کاوش ژنومی نشانه های انتخاب جهت شناسایی مکان های کروموزومی مرتبط با بیماری یون در گاوهای هلشتاین
Publish place: IRANIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE، Vol: 55، Issue: 3
Publish Year: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 19
This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJAS-55-3_003
تاریخ نمایه سازی: 15 مهر 1403
Abstract:
انتخاب باعث ایجاد نشانههای انتخاب در سطح ژنوم میشود. شناسایی نشانههای انتخاب در حیوانات در جهت ارتقا صفات اقتصادی و کاهش بیماریها، یکی از اصلیترین و چالش برانگیزترین تحقیقات در زمینه ژنتیک جمعیت است. در این تحقیق، با هدف شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت بین جمعیتهای گاوهای مبتلا به بیماری یون و سالم هلشتاین، پویش گستره ژنوم با استفاده از چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی (SNP) انجام شد. این تحقیق بر روی گاوهای گاوداری فوکا در اصفهان بر روی ۱۴۵ راس گاو هلشتاین انجام شد. بر اساس تراشه های ۳۰K شرکت ایلومینا تعیین ژنوتیپ و گاوها به دو گروه بیمار و سالم گروه بندی شدند. گروه بیمار شامل ۴۵ راس و گروه سالم شامل ۱۰۰ راس گاو بود. در این مطالعه برای شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب از دو آماره FST و XP-EHH استفاده شد. ژنهای شناسایی شده توسط آماره FST در دو جمعیت بیمار و سالم شاملRAB۳۷, ZC۳H۱۰, ESR۱ HSD۱۷B۶, KCNC۴, ERBB۳ و NACA بودند. ژنهای شناسایی شده توسط آماره XP-EHH در دو جمعیت بیمار و سالم شاملAK۱, ATP۸A۱, BTBD۱, C۱GALT۱, CCDC۶, CEP۲۹۵, CLGN, CLSTN۲, EHHADH, ERBB۴, FRK, GRID۲, GRIP۱ و LRP۶ بودند. اکثر ژن های شناسایی شده در این مطالعه با ایمنی، بیماری هایی مثل سرطان، شیردهی، ماهیچه های اسکلتی، چرخه فحلی، مصرف خوراک، چسبندگی اسپرم و رشد در ارتباط بود، که جزو صفات و ویژگی های مهم زیستی جاندار قرار می گیرد. مطمئنا مطالعات گستردهتر با تعداد نمونههای بیشتر، درک بهتری از ژنهای کاندید برای بیماری یون در گاو و طراحی برنامههای اصلاح نژادی موفق در جهت کاهش هزینههای ناشی از بیماری، ایجاد خواهد نمود.
Keywords:
Authors
فاطمه ناوشکی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران:
حسین مرادی شهربابک
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران
علی صادقی سفید مزگی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران:
جوهان سولکنر
. گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه بوکو، وینا، اتریش
مهدی جوان نیکخواه
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :