بررسی جامع ژن ها و eRNA های درگیر در سرطان معده و ساخت مدل پیش آگهی برای بقای کلی بیماران
Publish place: The Journal of Isfahan Medical School، Vol: 41، Issue: 724
Publish Year: 1402
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 62
This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_IMSJ-41-724_002
Index date: 2 November 2024
بررسی جامع ژن ها و eRNA های درگیر در سرطان معده و ساخت مدل پیش آگهی برای بقای کلی بیماران abstract
مقاله پژوهشیمقدمه: سرطان معده، یکی از شایع ترین سرطان ها و اولین علت مرگ ناشی از سرطان ها در ایران است. به دلیل دانش ناکافی در مورد عناصر مولکولی دخیل در بیماری برای معرفی زیست نشانگرهای تشخیصی/ پیش آگهی دهنده، بیماران مبتلا در مراحل بالاتر تشخیص داده می شوند که این امر منجر به پیش آگهی ضعیف این بیماران می شود. هدف مطالعه ی حاضر، بررسی جامع enhancer RNAs (eRNAs) به منظور تعیین ارتباطات مولکولی این عناصر با سایر ژن ها و ساخت یک مدل مرتبط با بقای بیماران بود.روش ها: اطلاعات خام توالی یابی رونوشت ها در نمونه های سرطان معده از پایگاه داده ی اطلس ژنوم سرطان اخذ و eRNAها و ژن های با بیان متمایز در نمونه های توموری نسبت به نمونه های غیرتوموری استخراج شد. سپس ژن های هدف eRNAهای با بیان متمایز بر اساس فاصله ی فیزیکی و همبستگی تعیین شدند و شبکه ی تنظیمی با استفاده از این عناصر ترسیم شد. در نهایت با انجام تحلیل رگرسیون کاکس تک متغیره و چندمتغیره، یک مدل پیش آگهی دهنده برای پیش بینی بقای کلی بیماران ساخته و کارآیی مدل بررسی شد.یافته ها: با انجام تحلیل تمایز بیانی، ۶۹ eRNA و ۲۶۰۶ ژن دارای بیان متمایز استخراج شدند و با تعیین ارتباطات بین آن ها، یک شبکه ی تنظیمی متشکل از ۸۴ گره و ۱۱۹ یال ترسیم شد. در نهایت یک مدل سه جزئی مرتبط با بقا ساخته شد که قادر به پیش بینی بقای بیماران بود.نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد، مدل سه جزئی ساخته شده شامل یک eRNA و دو ژن دیگر می تواند به عنوان ابزار پیش آگهی دهنده در سرطان معده مورد استفاده قرار گیرد؛ اگرچه مطالعات گسترده تری برای کاربرد بالینی این مدل لازم است.
بررسی جامع ژن ها و eRNA های درگیر در سرطان معده و ساخت مدل پیش آگهی برای بقای کلی بیماران Keywords:
رونوشت های نسخه برداری شده از افزاینده ها , سرطان های معده , تحلیل بقاء , زیست شناسی سامانه ای , توالی یابی RNA
بررسی جامع ژن ها و eRNA های درگیر در سرطان معده و ساخت مدل پیش آگهی برای بقای کلی بیماران authors
بصیره بهرامی
کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک و بیولوژی مولکولی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران
پروانه نیک پور
دانشیار، گروه ژنتیک و بیولوژی مولکولی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
