تمایز ارقام مقاوم ملون در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis بر اساس صفات ظاهری و الگوی حضور ژن های مقاومت
Publish place: Journal of horticulture science، Vol: 38، Issue: 3
Publish Year: 1403
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 66
This Paper With 21 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JHSUM-38-3_008
Index date: 18 November 2024
تمایز ارقام مقاوم ملون در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis بر اساس صفات ظاهری و الگوی حضور ژن های مقاومت abstract
دست یابی به نشانگرهای مرتبط به صفت مقاومت به بیماری پژمردگی فوزاریومی ملون می تواند در پیشبرد برنامه های اصلاحی موثر باشد. بدین منظور تعدادی از ارقام استاندارد ملون شامل ‘Charentais T’، ‘Charentais Fom۱’، ‘Charentais Fom۲’ و ‘BG-۵۳۸۴’ با سطوح مقاومتی مختلف در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis، و یک رقم محلی به نام’خاتونی‘، از نظر صفات ظاهری گیاه و همچنین الگوی حضور ژن های مقاومت در برابر بیماری ها مورد بررسی قرار گرفتند. بر اساس نتایج بدست آمده هر چند امکان تمایز ارقام بر اساس صفات ظاهری ممکن بود ولی از آنجا که مطالعه این صفات در ارزیابی تعداد زیاد نمونه ها در مطالعات گزینشی کاری بسیار زمان بر و هزینه بر است، الگوی حضور ژن های مقاومت در داده های ژنومی این ارقام مورد بررسی قرار گرفت. آنالیزهای داده های ژنومی ملون با هدف مکان یابی موقعیت گروه لینکاژی MRGH۲۱ به عنوان یکی از گروه های لینکاژی حامل تعدادی از ژن های مقاومت انجام شد. توالی این گروه لینکاژی از دو پایگاه بانک ژن در NCBI و پایگاه MELONOMICS ردیابی شد و توالی حدفاصل دو ژن MRGH۱۲ (MELO۳C۰۲۲۱۴۳.۲.۱) و MRGH۱۳ (MELO۳C۰۰۰۳۳۵.۲.۱) در برگیرنده این گروه لینکاژی روی کروموزوم شماره Ch۰۹ استحصال شد. وجود جهش های نقطه ای متعدد در داده های ژنومی سبب شد تا توالی ژن MRGH۱۳ جهت ردیابی در ارقام ملون مورد بررسی قرار گیرد. آغازگرهای اختصاصی PSh۲۱-F/R برای ردیابی بخشی از توالی این ژن طراحی شد. نتایج ردیابی نشان داد تک باند اختصاصی در ارقام ‘Charentais Fom۱’ و ‘BG-۵۳۸۴’ منطبق با اندازه مورد انتظار قابل ردیابی است. نقش احتمالی پروتئین کدشونده توسط ژن MRGH۱۳ با آنالیز توالی آن در ابزار تحت شبکه InterPro این پروتئین را به عنوان یک عضو خانواده پروتئین های حامل توالی های تکراری غنی از لوسین تایید نمود و موقعیت دمین های TIR، NB-ARC و LRR را مشخص نمود. فرآیندهای زیستی مرتبط با پروتئین MRGH۱۳ در ابزار تحت شبکه QuickGO ارتباط آن را در مسیر پیام رسانی تنظیم کننده پاسخ های ایمنی نشان داد. در مطالعات آتی ارزیابی قابلیت تمایز ارقام مقاوم براساس ژن های مقاومت از جمله ژن MRGH۱۳ در تعداد بیشتری از نمونه ها مورد بررسی پیشنهاد می گردد. همچنین با توجه به کارکردهای پیش بینی شده برای پروتئین MRGH۱۳ بررسی نحوه برهمکنش آن با دیگر پروتئین های مقاومت و همچنین پروتئین های عوامل بیماری زا می تواند در شناسایی نقش کارکردی آن در مقاومت مفید باشد.
تمایز ارقام مقاوم ملون در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis بر اساس صفات ظاهری و الگوی حضور ژن های مقاومت Keywords:
بیماری پژمردگی فوزاریومی ملون , ژن های مقاومت حامل توالی های تکراری غنی از لوسین , داده های ژنومی ملون , گزینش مبتنی بر صفات مرتبط با مقاومت
تمایز ارقام مقاوم ملون در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis بر اساس صفات ظاهری و الگوی حضور ژن های مقاومت authors
فرهاد شکوهی فر
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
مجتبی ممرآبادی
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
صهبا طوسی
گروه بیوتکنولوژی و به نژادی گیاهان زراعی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
