باکتری
پنوموکک سالیانه باعث مرگ و میر تعداد قابل توجهی از اطفال کمتر از ۵ سال در جهان میشود. سروتیپ ۱۹F این باکتری عاملی عمده در ایجاد بیماریهای تهاجمی در کودکان است . کپسول
پنوموکک آنتی ژن مورد استفاده در واکسنهای موجود
پنوموکک است که با توجه به ایمنی زایی ضعیف آن در اطفال، بصورت شیمیایی به یک حامل پروتئینی ایمونوژنیک متصل (کنژوگه ) میگردد. هزینه بالای ایجاد واکسنهای کنژوگه باعث توجه به ایجاد واکسنهای پروتئینی شده است . مطالعه قبلی ما نشان داد که
اتولیزین پنوموکک سروتیپ ۱۹F دارای خصوصیات آنتی ژنیک و نیز عدم القای خود ایمنی بوده است . با توجه به اهمیت پاسخ آنتی بادی در ایجاد محافظت بر ضد
پنوموکک ، آنالیزوضعیت اپیتوپهای سلولB برای بررسی کارآیی پروتئین
اتولیزین بعنوان کاندید واکسن ضروری است . لذا هدف این مطالعه بررسی وجوداپیتوپهای محافظتی سلولB در
اتولیزین با ابزار بیوانفورماتیک است . دو برنامه BCPreds وBepipred برای تعیین اپیتوپهای خطی سلولB
اتولیزین بکار رفتند. تعیین اپیتوپهای کونفورماسیونی سلولB با استفاده از برنامه CBTope انجام شد. قابلیت اپیتوپها در القای پاسخ ایمنی محافظتی با برنامه VaxiJen بررسی شد. نتایج ما نشان دادند که اپیتوپهای محافظتی خطی تعیین شده در
اتولیزین با دو برنامه BCPreds وBepipred در سه ناحیه همپوشانی دارند که در ضمن این نواحی دارای امینو اسیدهای مشترک با اپیتوپهای کونفورماسیونی هستند. وجود این نواحی اپیتوپی محافظتی در
اتولیزین نشان میدهد که این پروتئین کاندیدی مناسب در ایجاد واکسن بر ضد
پنوموکک سروتیپ ۱۹F میباشد.