پیش بینی بیوانفورماتیکی توالی های حفاظت شده میکروآرانای و مطالعه روند ایجاد و از بین رفتن آنها در بقولات
Publish place: Modares Journal of Biotechnology، Vol: 14، Issue: 1
Publish Year: 1401
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 43
This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_BIOT-14-1_002
Index date: 24 December 2024
پیش بینی بیوانفورماتیکی توالی های حفاظت شده میکروآرانای و مطالعه روند ایجاد و از بین رفتن آنها در بقولات abstract
چکیده
خانواده بقولات یکی از مهمترین خانوادههای گیاهان به شمار میآید. در این تحقیق توالیهای پیشساز میکروآر ان ای در هفت گونه از بقولات شامل Arachis hypogaea ، Glycine max، Glycine soja، Lotus japonicus، Medicago truncatula، Phaseolus vulgaris و Vigna unguiculata به شیوه جستجوی توالی های پیش ساز حامل توالیهای همولوگ میکروآر ان ای بالغ در میان توالی های نسخه برداری شونده و با در نظر گرفتن مشخصات اختصاصی توالی و ساختمان دوم توالی پیش ساز در میکروآران ای های شناسایی شده، پیش بینی و مشخصات آنها مورد توجه قرارگرفت. همچنین جایگاه ژنومی توالی های پیش ساز تعیین گردید. در این مطالعه، ۴۱۴ توالی پیش ساز میکرو آر ان ای متعلق به ۱۳۰ خانواده در هفت گونه مذکور که مشخصات توالی و ساختار دوم آنها با مشخصات توالی های پیشساز میکروآران ای گیاهی همخوانی داشت، پیش بینی و مشخصات آنها گزارش گردید. روابط بین گونهها براساس روند ایجاد و از بین رفتن خانوادههای میکروآران ای در هرگونه بر اساس بیشینه پارسمیونی به شیوه دولو بدست آمد و از این طریق درخت فیلوژنتیکی ارتباط گونهها ترسیم شد. خانوادههای میکروآر ان ای به وجود آمده و از بین رفته در گونههای مورد مطالعه در طول پیدایش و تکامل گونه ها مشخص و گزارش شد. نتایج نشان داد روند ایجاد خانوادههای میکروآرانای در این خانواده اخیرا از شدت زیادی برخوردار بوده است. روابط بین گونه ها بر اساس روند ایجاد و از بین رفتن خانواده های میکروآرانای به شیوه مدل بیشینه پارسیمونی همخوانی با روابط فیلوژنی ندارد. در این مطالعه تعدادی از خانوادههای میکروآرانای به عنوان خانوادههای اختصاصی گونه و اختصاصی گروه شناسایی گردید که امکان استفاده از آنها به عنوان شناسهگر گونه/گروه وجود دارد.
پیش بینی بیوانفورماتیکی توالی های حفاظت شده میکروآرانای و مطالعه روند ایجاد و از بین رفتن آنها در بقولات Keywords:
microRNA , Leguminosae , Maximum dollo parsimony , EST based-homology search , : میکروآران ای , خانواده بقولات , بیشینه پارسیمونی دولو , جستجوی توالی های همولوگ میکروآران ای
پیش بینی بیوانفورماتیکی توالی های حفاظت شده میکروآرانای و مطالعه روند ایجاد و از بین رفتن آنها در بقولات authors
بهزاد حاجی اقراری
۱- Department of Agricultural Biotechnology, College of Agriculture, Jahrom University, Jahrom, Iran
مجاهد کمالی زاده
Department of Agricultural Biotechnology, College of Agriculture, Jahrom University, Jahrom, Iran.
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
