پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی
Publish place: Modares Journal of Biotechnology، Vol: 12، Issue: 1
Publish Year: 1399
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 58
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_BIOT-12-1_007
Index date: 24 December 2024
پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی abstract
هدف: EMT فرایندی برگشتپذیر و ضروری در طول جنین زایی، بهبود زخم و پیشرفت سرطان است. در بسیاری از سرطان ها، EMT می تواند ویژگیهای تهاجمی تومور را افزایش دهد. اخیرا miRNAها به عنوان کلاس جدیدی از RNA های غیر کدکننده تنظیمگر بیان ژن در مراحل پس از ترجمه دخیل در فرایندEMT شناخته میشوند. بااین حال، مکانیسم و اثر دقیق miRNAها در فرایند EMT در سلول های سرطانی انسان هنوز به خوبی مشخص نیست. این مطالعه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک پیش بینی کننده miRNAهای تنظیم کننده ژن های اصلی در فرایندEMT ، تلاش می کند نقش miRNAها را در فرایند EMT روشن کند.
مواد و روش ها: در این مطالعه، با استفاده از پایگاه های دادههای تحت وب و ابزارهای پیش بینی برهم کنش miRNAها نظیر DIANA، TargetScan و miRSystem، برهم کنشmiRNAهای تنظیم کننده ژنهای N-cadherin ، TWIST۱، ZEB۱، SNAIL و Vimentin به عنوان بیومارکرهای اصلی سلول های مزانشیمی بررسی شد.
نتایج: اثرات miRNAهای متفاوت براساس الگوریتم هر پایگاه بر ژن های نامزد بررسی و داده های به دست آمده از پایگاه های مختلف باهم اشتراک گرفته شد. نتایج نشان داد که یازده miRNA با احتمال بالا به طورمشترک میتوانند در فرایند EMT/MET نقش داشته باشند.
نتیجه گیری: براساس یافته های ما، میتوان پیش بینی کرد که با توجه به نمره بالاmiRNA های انتخاب شده با ژن های نامزد، این miRNAها میتوانند نقشی مهم در فرایند EMT/MET داشته باشد. ازاین رو، می توان از آنها به عنوان کاندیدهای مناسب برای تحقیقات بالینی آینده استفاده کرد.
کلمات کلیدی: EMT،MET ، TargetScan، miRSystem، microRNA
پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی Keywords:
پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی authors
صدیقه سادات مرتضوی
Department of Biology, Faculty of Sciences, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran
صدیقه غربی*
Department of Biology, Faculty of Sciences, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran
مریم شاه علی*
Department of Quality Control, Research and Production Complex Pasteur Institute of Iran, Tehran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
