مروری بر شناسایی ژن های هدف میکروRNAها با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی در تحقیقات زیست پزشکی
Publish place: Modares Journal of Biotechnology، Vol: 12، Issue: 4
Publish Year: 1400
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 67
This Paper With 18 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_BIOT-12-4_008
Index date: 24 December 2024
مروری بر شناسایی ژن های هدف میکروRNAها با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی در تحقیقات زیست پزشکی abstract
میکروRNAها گروهی از RNAهای غیر کدکننده کوچک هستند که بیان ژن در یوکاریوتها را در سطح پس از رونویسی تنظیم میکنند. میکروRNAها با تنظیم بیان تعداد زیادی از mRNAها، به عنوان تنظیم کنندههای اصلی فرآیندهای زیستی مختلفی مانند تکوین جنینی، تکثیر و تمایز سلولی و مرگ برنامه ریزی شده سلول عمل می کنند. بنابراین شناسایی میکروRNAها و ژنهای هدفشان در شناسایی مکانیسم های رشد و نمو و نیز فرآیندهای دخیل در ایجاد و پیشرفت بیماری ها بسیار موثر است. به دلیل هزینه بر بودن کارهای تجربی مولکولی، شناسایی میکروRNAهای موثر از طریق روش های بیوانفورماتیکی و زیستشناسی محاسباتی ارزان تر و سریعتر از روشهای معمول آزمایشگاهی است. تعدادی بانک اطلاعاتی و نرم افزار بر خط برای کمک به محققان در پیشبینی ژن های هدف میکروRNAها توسعه یافته و آزادانه در دسترس قرار گرفته اند. نرم افزارهای موجود برای پیشبینی ژنهای هدف میکروRNAها، از طیف وسیعی از اطلاعات توالی یابی، داده های مولکولی بیان ژن و نیز الگوریتم های محاسباتی مختلف استفاده می کنند. تعدادی از مهمترین این ابزارهای برخط شامل miRWalk، TargetScan، RNAhybrid، Diana-microT، miRanda و MirTarget هستند. چهار ویژگی اصلی برهمکنش میان میکروRNA با mRNAهدف شامل جفتشدگی در ناحیه Seed، حفاظت شدگی توالی هدف، انرژی آزاد و دسترسی به مکان اتصال در رونوشت هدف، در الگوریتم تمامی این ابزارهای پیشبینی هدف میکروRNAها به کار گرفته شده است. هدف از این مطالعه بررسی آخرین یافته ها در مورد ویژگی ها و توانایی های بیوانفورماتیکی پیش بینی ژن های هدف میکروRNA، مقایسه کارایی این ابزارها و در نهایت معرفی کارآمدترین ابزار در زمینه پیش بینی ژن هدف میکروRNAها برای تحقیقات بیوانفورماتیکی، زیست پزشکی و پزشکی مولکولی است.
مروری بر شناسایی ژن های هدف میکروRNAها با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی در تحقیقات زیست پزشکی Keywords:
microRNAs , Bioinformatics , RNA databases , Target gene , Posttranscriptional RNA Processing , میکروRNA , بیوانفورماتیک , داده پایگاه های RNA , ژن هدف , پردازش های پس از رونویسی RNA
مروری بر شناسایی ژن های هدف میکروRNAها با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی در تحقیقات زیست پزشکی authors
مریم کرائی
Department of Biological Science, Faculty of Science, University of Kurdistan, Sanandaj, Iran
شمس الدین احمدی
Department of Biological Science, Faculty of Science, University of Kurdistan, Sanandaj, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
