سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

بررسی مکانیسم اثر مهارکنندگی پپتید مشتق از تومستاتین بر فعالیت اینتگرین : یک مطالعه شبیه سازی دینامیک مولکولی

Publish Year: 1399
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 41

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_BIOT-11-2_002

Index date: 24 December 2024

بررسی مکانیسم اثر مهارکنندگی پپتید مشتق از تومستاتین بر فعالیت اینتگرین : یک مطالعه شبیه سازی دینامیک مولکولی abstract

مهارکننده های اینتگرین از طریق تغییر ویژگی های ساختاری و حرکتی اینتگرین نقش مهارکنندگی خود را اعمال می کنند. اما مکانیسم دینامیک مولکولی آن به طور مشخص کامل نیست. تومستاتین یک پروتئین ضدرگزایی مشتق شده از کلاژن است، اما اطلاعات کمی در مورد مکانیسم ضدرگزایی و ضد توموری آن در دست است. پپتید ۱۹ آمینواسیدی مشتق شده از تومستاتین دارای ویژگی های ضد رگ زایی و ضد توموری مشابه پروتئین اصلی است. در این مطالعه با استفاده از داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی به مطالعه مکانیسم مولکولی مهارکنندگی پپتید مذکور پرداخته شد. مطالعات نشان می دهد، جایگاه اتصال پپتید در مرز بین دمین های EGF-۴ و Hybrid است. پپتید از طریق اندرکنش های هیدروفوب در مرز بین دمین های EGF-۴/Hybrid اثر مهارکنندگی خود را اعمال می کند. همچنین نتایج مربوط به سطح در دسترس حاکی از اثر مهارکنندگی پپتید در باز شدن دمین های اینتگرین از یکدیگر و فعال شدن آن دارد. درواقع پپتید از طریق پایدارکنندگی حالت بسته اینتگرین نقش مهارکنندگی خود را اعمال می کند. این یافته ها می تواند در طراحی مهارکننده های نوین برای اینتگرین راهگشا باشد.

بررسی مکانیسم اثر مهارکنندگی پپتید مشتق از تومستاتین بر فعالیت اینتگرین : یک مطالعه شبیه سازی دینامیک مولکولی Keywords:

بررسی مکانیسم اثر مهارکنندگی پپتید مشتق از تومستاتین بر فعالیت اینتگرین : یک مطالعه شبیه سازی دینامیک مولکولی authors

محمد قربانی

Department of Biophysics, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran

مجید تقدیر

Department of Biophysics, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Mehrbod, M., S. Trisno, and M.R. Mofrad, On the activation ...
Xiong, J., H.E. Balcioglu, and E.H. Danen, Integrin signaling in ...
Morse, E.M., N.N. Brahme, and D.A. Calderwood, Integrin cytoplasmic tail ...
Springer, T.A., J. Zhu, and T. Xiao, Structural basis for ...
Shattil, S.J., C. Kim, and M.H. Ginsberg, The final steps ...
Chen, W., et al., Molecular dynamics simulations of forced unbending ...
Eikesdal, H.P., et al., Identification of amino acids essential for ...
Paladino, A., et al., High affinity vs. native fibronectin in ...
Monteiro Torres, P.H., G. Limaverde Soares Costa Sousa, and P.G. ...
He, G.-A., et al., Canstatin-N fragment inhibits in vitro endothelial ...
Comeau, S.R., et al., ClusPro: a fully automated algorithm for ...
De Vries, S.J., M. Van Dijk, and A.M. Bonvin, The ...
DeLano, W.L., The PyMOL molecular graphics system. http://www. pymol. org, ...
Lindahl, E., B. Hess, and D. Van Der Spoel, GROMACS ...
Essmann, U., et al., A smooth particle mesh Ewald method. ...
Danhier, F., A. Le Breton, and V.r. Préat, RGD-based strategies ...
Kapp, T.G., et al., A comprehensive evaluation of the activity ...
نمایش کامل مراجع