بررسی برهمکنش ترکیبات گیاهی دارویی علیه پروتئاز Mpro در گونه های ویروس SARS-CoV-۲
Publish Year: 1403
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 35
This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JHBMI-11-3_003
Index date: 28 February 2025
بررسی برهمکنش ترکیبات گیاهی دارویی علیه پروتئاز Mpro در گونه های ویروس SARS-CoV-۲ abstract
مقدمه: بیماری کرونا (COVID-۱۹) یک بیماری عفونی است که توسط ویروس SARS-CoV-۲ ایجاد میشود. شناسایی ترکیبات گیاهی مفید و به کارگیری آنها جهت هدف گیری پروتئین های مهم دخیل در آلوده سازی و تکثیر ویروس کرونا، گزینه ای کارآمد در مبارزه علیه این بیماری محسوب میشود. هدف از این پژوهش بررسی برهمکنش ترکیبات گیاهی دارویی بومی علیه پروتئازMpro گونه های مختلف ویروس SARS -COV۲ و تعیین و ارزیابی ترکیب نهایی با روش HPLC بود.
روش کار: ساختار سه بعدی پروتئاز Mpro از بانک داده PDB به دست آمد. ترکیبات مختلف ضدویروسی گیاهی از پایگاه های داده و مقالات مختلف گردآوری شد. داکینگ مولکولی با استفاده از AutoDock Vina انجام شد. با استفاده از سرورهای مختلف ویژگی ها و خصوصیات ترکیبات منتخب بررسی شد. جهش زایی برای آمینواسید متیونین ۴۹ انجام و ساختار جدید سه بعدی پروتئین Mpro در گونه های مختلف ویروس مدلسازی شد. آنالیز داکینگ برای چهار ترکیب منتخب به لحاظ انرژی اتصال انجام شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) برای بررسی پایداری ساختار نهایی و HPLC برای ارزیابی حضور ترکیب موثره در گیاه موردنظر انجام شد.
یافته ها: نتایج داکینگ نشان داد ترکیب Cyanidin-۳ ۵-di-o-glucoside به لحاظ مجموع انرژی اتصال برای مهار Mpro مطلوب است. خصوصیات فارماکوکینتیک این ترکیب تعیین شد. نتایج MD نشان داد کمپلکس Mpro-Cyanidin-۳ ۵-di-o-glucoside دارای ثبات است. با روش HPLC تایید شد که Cyanidin-۳ ۵-di-o-glucoside در عصاره انار ایرانی موجود است.
نتیجه گیری: ترکیب Cyanidin-۳ ۵-di-o-glucoside که در عصاره انار بومی ایران یافت میشود می تواند با میل اتصال بالایی به Mpro متصل شده و آن را مهار کند و به عنوان دارویی که مستقیم بر ویروس کرونا تاثیر بگذارد مورد ارزیابی قرار گیرد.
بررسی برهمکنش ترکیبات گیاهی دارویی علیه پروتئاز Mpro در گونه های ویروس SARS-CoV-۲ Keywords:
Mpro Protein , Coronavirus , Native plants , Molecular docking , Molecular dynamics , Mpro , کرونا , گیاهان بومی , داکینگ مولکولی , شبیه سازی دینامیک مولکولی
بررسی برهمکنش ترکیبات گیاهی دارویی علیه پروتئاز Mpro در گونه های ویروس SARS-CoV-۲ authors
رویا فلاح پور
MSc of Science, Islamic Azad University, Medical Branch, Tehran, Iran
سید حمید جمال الدینی
Assistant professor, Islamic Azad University, Medical Branch, Tehran, Iran
نجف الهیاری فرد
Assistant professor, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, Tehran, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
