همانند سازی، تعیین ترادف آنالیز بخشی از دی.ان.ای خارج کروموزومی فیتوپلاسمای فیلودی لوبیا

فیتوپلاسماها پروکاریوتهای فاقد دیواره سلولی، غیرقابل کشت و محدود به آوندهای آبکشی گیاه بودند و عامل بیماری در بسیاری از گیاهان هستند. ژنوم در فیتوپلاسماها یک قطعه دی.ان.ای کروموزومی غنی از بازهای آدنین و تیمین و چند قطعه دی.ان.ای خارج کروموزومی است، لیکن در فیتوپلاسماها نقش پلاسمید همراه با آنها تا کنون مشخص نشده است. بمنظور مطالعه پلاسمید فیتوپلاسمای فیلودی لوبیا، از لوبیای مشکوک به آلودگی به فیتوپلاسما نمونه برداری و استخراج دی.ان.ای کل انجام شد. تشخیص فیتوپلاسما در آزمون PCR با استفاده از جفت آغازگر P1 و P7 انجام و محصول PCR همسانه سازی تعیین ترادف گردید. به منظور تکثیر پلاسمید فیتوپلاسما از نمونه لوبیای آلوده از آنزیم فی دی. ان.ای پلیمراز استفاده گردید. و قطعه ای از پلاسمید فیتوپلاسما همسانه سازی و تعیین ترادف شد. براساس ترادف ژن آر.ان.ای دیبوزومی فیتوپلاسمای فیلودی لوبیا متعلق به گروه 16SrVI یا گروه جاروئی شبدر است. قطعه ای از پلاسمید فیتوپلاسمای فیلودی لوبیا به طول 2508 باز که تعیین ترادف گردید، بیشترین شباهت را با Beat leaf hopper transmitted virescence phytoplasma داشت. این قطعه دارای سه چارچوب خواندنی باز به طول 444، 759 و 567 است. این اولین گزارش از ردیابی و تعیین ترادف پلاسمید فیتوپلاسمای فیلودی لوبیا می باشد.

Keywords:

فیتوپلاسما , دی.ان.ای خارج کروموزومی , همانند سازی دایره غلتان