بررسی فیلوژنتیکی ژرم پلاسم های سیب با استفاده از ISSR و نرم افزار PyElph
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 878
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0925
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
Abstract:
سیب (malus domestica Borkh) از نظر اقتصادی یکی از مهمترین درختان میوه در جهان است. حدود 59 گونه و 7500 رقم در سراسر دنیا شناسایی شده است. در این پژوهش، با استفاده از مارکر مولکولی ISSR، انگشت نگاری و تعیین درجه شباهت بین 6 رقم سیب بومی و تجاری، شامل رقم های شفیع آبادی، گلاب کهنز red starking, delbarstival, idared و royal gala با استفاده از 3 پرایمر UBC810, (AGC)5GG و(GA(9C توسط نرم افزار PyElph صورت گرفت. پس از انجام PCR و تهیه ژل آگارز، الکتروفورز افقی انجام شد و بعد از رنگ آمیزی با اتیدیوم بروماید، با استفاده از اشعه UV تصویر ژل به دست آمد و در نرم افزار PyElph مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. PyElph یک نرم افزار open source بر پایه Python (یک زبان برنامه نویسی) برای تحلیل و بررسی تصاویر ژل بوده که می تواند برای مطالعات مختلف ژنتیکی و زیست شناسی مورد استفاده قرار گیرد. درخت UPGMA حاصل از نرم افزار PyElph نشان دهنده شباهت ژنتیکی رقم های delbarstival, royal gala و red starking است، این درخت نزدیکی دو رقم گلاب کهنز و idared را نیز نشان می دهد. در احلیکه رقم شفیع آبادی با فاصله بیشتری نسبت به سایر ژنوتیپ ها قرار گرفته که نشان دهنده تفاوت بیشتر این رقم با سایر ارقام است.
Keywords:
Authors
شکوفه فاضلی
دانشجوی کارنشاسی ارشد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
مسعود شیدایی
استاد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
رضا ذاتی کیخا
دانشجوی کارنشاسی ارشد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
سیما دامیار
موسسه تحقیقات نهال و بذرکرج