کاربرد تکنیک مولکولی One-step-RT-LAMP در تشخیص ویروس SARS-CoV-۲ در نمونه های نازوفارنکس جمع آوری شده از مراکز درمانی و رفرانس استان تهران

Publish Year: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 102

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_YAFTE-26-4_002

تاریخ نمایه سازی: 18 آبان 1404

Abstract:

مقدمه: تشخیص مولکولی سریع، دقیق و اختصاصی ویروس SARS-CoV-۲ در راستای پیشگیری و مبارزه با بیماری کرونا بسیار حائز اهمیت می باشد؛ لذا هدف از این تحقیق بررسی ارزش تشخیصی تکنیک مولکولیLAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification) در ارزیابی سریع، کسب نتایج دقیق و کاهش هزینه های آزمایش کرونا در مقایسه با دیگر روش های مولکولی روتین می باشد. مواد و روش ها: طی این مطالعه مقطعی توصیفی تحلیلی ۳۴۲ نمونه نازوفارنکس از مراکز درمانی رفرانس شهر تهران جمع آوری شد. در مرحله بعد، استخراج RNA از نمونه ها انجام شد. پس از طراحی پرایمر برای ژن N، سنجش RT-LAMP انجام شد. برای تایید نتایج، محصولات LAMP، بر روی ژل آگارز الکتروفورز شدند. همچنین از نظر حساسیت و ویژگی، تکنیک RT-LAMP مورد ارزیابی قرار گرفت. جهت تجزیه و تحلیل آماری نتایج از نرم افزار SPSS  نسخه ۲۲ و آزمون های آماری مجذور کای، توافق کاپا و دقیق فیشر استفاده شد. یافته ­ها: نتایج نشان داد که ارتباط معناداری بین جنسیت و شدت بیماری وجود دارد (۰۰۱/۰>(P، حال آنکه ارتباط معناداری از نظر متغیر سن وجود نداشت (۰۵/۰>(P. از نظر علائم بالینی ارتباط معناداری بین شدت عفونت ویروس با علائم تب، سرفه و سردرد وجود داشت (۰۰۱/۰>(P. همچنین از نظر آماری ارتباط معناداری بین بیماری دیابت و شدت بیماری مشاهده شد (۰۰۱/۰> .(Pاز نظر حساسیت و ویژگی تکنیک RT-LAMP، میزان حساسیت در این تکنیک رقت ۱۰۱×۱ و ویژگی ۱۰۰٪ بدست آمد. بحث و نتیجه ­گیری: تشخیص سریع و به موقع ویروس کرونا بدلیل سرعت سرایت بالای ویروس بسیار حیاتی می باشد. لذا نیاز به روش تشخیصی سریع و ارزان و قابل انجام در مکان های مختلف و مقرون به صرفه با حساسیت و ویژگی بالا احساس می گردد. بر اساس نتایج بدست آمده از مطالعه حاضر تکنیک RT- LAMP روشی سریع، حساس و موثر در تشخیص SARS-CoV-۲ می باشد.

Keywords:

SARS-CoV-۲ – RT-LAMP – Sensitivity & Specificity , SARS-CoV-۲ – RT-LAMP – حساسیت و ویژگی

Authors

هومن حنیفه پور

Department of Microbiology, Faculty of Biological Sciences, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

شیرزاد فلاحی

Hepatitis Research Center, School of Medicine, Lorestan University of Medical Sciences, Khorramabad, Iran

فاطمه اشرفی

Department of Microbiology, Faculty of Biological Sciences, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

الهام سیاسی

Department of Microbiology, Faculty of Biological Sciences, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Fung TS, Liu DX. Human Coronavirus: Host-Pathogen Interaction. Annual review ...
  • Wang L, Wang Y, Ye D, Liu Q. Review of ...
  • Maier HJ, Bickerton E, Britton P. Preface. Coronaviruses. Methods in ...
  • Notomi T, Okayama H, Masubuchi H, Yonekawa T, Watanabe K, ...
  • Ahn SJ, Baek YH, Lloren KKS, Choi WS, Jeong JH, ...
  • Vanhomwegen J, Kwasiborski A, Diop A, Boizeau L, Hoinard D, ...
  • Vergara A, Vendrell R, Alejo-Cancho I, Rodríguez C, Vila J, ...
  • Lamb LE, Bartolone SN, Ward E, Chancellor MB. Rapid detection ...
  • Park G-S, Ku K, Baek S-H, Kim S-J, Kim SI, ...
  • Lu R, Wu X, Wan Z, Li Y, Jin X, ...
  • Yan C, Cui J, Huang L, Du B, Chen L, ...
  • Fowler VL, Armson B, Gonzales JL, Wise EL, Howson ELA, ...
  • Zhu X, Wang X, Han L, Chen T, Wang L, ...
  • Bokelmann L, Nickel O, Maricic T, Pääbo S, Meyer M, ...
  • Khanizadeh S, Malekshahi A, Hanifehpour H, Birjandi M, Fallahi S. ...
  • Novosad P, Jain R, Campion A, Asher S. COVID-۱۹ mortality ...
  • Xu B, Gutierrez B, Mekaru S, Sewalk K, Goodwin L, ...
  • Paschou SA, Psaltopoulou T, Halvatsiotis P, Raptis A, Vlachopoulos CV, ...
  • Shi Q, Zhang X, Jiang F, Zhang X, Hu N, ...
  • Sarker A, Lakamana S, Hogg-Bremer W, Xie A, Al-Garadi MA, ...
  • نمایش کامل مراجع