آنالیز توالی تکراری به منظور تایپینگ و بررسی ارتباطات فیلوژنتیک سویه هایSalmonellaدر ایران

Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 741

متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0530

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

Abstract:

اعضای جنسSalmonellaبه عنوان عامل مهمی در ایجاد عفونت های گوارشی در انسان و حیوان شناخته شده اند. تمایز بین سویه های Salmonellaدر سطح زیر گونه برای بررسی های اپیدمیولوژیک بویژه در اپیدمی هایSalmonellaاهمیت دارد. چندین روش تایپینگ بر اساس فنوتیپ و ژنوتیپ تاکنون معرفی شده اما همچنان بررسی ها جهت تعیین بهترین روش ادامه دارد. در این پژوهش از دو روش ERIC PCR و REP PCRکه بر اساس آنالیز توالی های تکراری ژنومSalmonellaهستند ، برای تمایز و شناسایی 74 سویه Salmonellaجدا شده از بیماران ایرانی استفاده گردید. نتایج نشان داد کهREP PCRقدرت بیشتری نسبت بهERIC PCRدر تمایزسویه هایSalmonellaدارد به طوری که باREP PCR55 گروه ژنوتیپی و باERIC PCR48 گروه حاصل گردید. زمانی که نتایج دو متد با هم ترکیب شدند 72 گروه مجزا حاصل شد که نشان می دهد ترکیب دو روش قدرت تمایز بسیار خوبی برای سویه های Salmonellaدارد. در نتیجه برای مطالعات اپیدمیولوژیک و نیز ارتباطات فیلوژنتیک استفاده همزمان از این دو روش پیشنهاد می گردد

Authors

فهیمه باغبانی آرانی

گروه ژنتیک،دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین- پیشوا، ورامین، ایران

عطیه هاشمی

گروه بیوتکنولوژی دارویی،دانشکده داروسازی،دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Albufera, U., B hugaloo-Vial, P., Issack, M., Jaufe erally-Fakim, Y. ...
  • Gupte, S., 2006. The short text book of medical microbiology. ...
  • Lim, H., Lee, K. H., Hong, C.-H., Bahk, G.-J., Choi, ...
  • Maniatis T, fritsch EF and sambrook . 1982. Molecular cloning: ...
  • Nath, G., Maurya, P., Gulati, A. K. 2010.ERIC PCR and ...
  • Rohlf FJ. 1998 NTSYS-pc, Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. ...
  • نمایش کامل مراجع