پیش گویی ساختار سوم وتعیین کیفیت پروتئینOMPCدر نایسریا مننژیتیدیس
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 619
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_0677
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
Abstract:
باکتری نایسریامننژیتیدیس(مننگوکوک)باکتری گرم منفی شایعی است که علت اصلی مننژیت باکتریایی کودکان میباشدOMPCترکیبی پروتئینی در غشای خارجی این باکتری است که بعنوان یک پروتئین حاملcarrier در غشا بوده که نقش مهمی را در نقل و انتقال مواد در عرض غشای سلول بازی می کند. پیش بینی میشود تولید آنتی بادی بر علیه این پروتئین خارجی سلولی بتواند مسیر جذب مواد غذایی ضروری مورد نیاز باکتری را مسدود کرده و سبب مرگ باکتری گردد. ساختار سوم پروتئین برای آنتیبادیها و سلولهایBاهمیت دارد و اکثر اپیتوپهای سلولBدرساختارپیچ های بتا Beta turns قرار دارند.در انتخاب بخشی از پروتئین که دارای خاصیت اپیتوپی بوده و بتوان آن را بهعنوان واکسن انتخاب نمود، بنابراین ساختار سوم پروتئین میتواند یکی از معیارهای گزینش باشد. از ابزارهای بیوانفورماتیکی میتوان برای پیشبینی ساختار سوم بهره برد. . نرم افزارesypredبرای پیش گویی ساختار سوم پروتئین و نرم افزارRampage Ramachandranبرای ارزیابی ساختار سه بعدی پیش گویی شده مورد استفاده قرار گرفت.بیش از 95 درصد از اسید امینه های پیش گویی شده در ناحیه مجاز از نمودار راماچاندران قرار دارد
Keywords:
Authors
مریم توحیدی نیا
دانشگاه علم و هنر یزد
سیدمهدی طباطبایی
دانشگاه علم و هنر یزد
فاطمه سفید
دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی یزد
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :