تنوع ژنتیکی ویروس پیچیدگی برگ شلغم در استان فارس

ویروس پیچیدگی برگ شلغمTurnip curly top virus, TCTV) یک جمینیویروس منحصربهفرد است که اخیراً از ایران گزارش شده است. تاکنون جدایههای معدودی از این ویروس معرفی شدهاند، با این وجود، بررسی جامعی در زمینه تنوع ژنتیکی آن در مناطق آلودهصورت نگرفته است. به منظور مطالعه تغییرات ژنتیکی ویروس، در سال های 1390 و 1391 از مزارع آلوده گیاهان شلغم با علائمپیچیدگی برگ و تورم رگبرگ در پشت برگ، واقع در اطراف شیراز نمونه برداری انجام شد. بعد از استخراج دی ان ای کل از نمونه ها، ژنوم 24 جدایه ویروس با استفاده از آنزیم فی دی ان ای پلیمراز به روش دایره غلطان و بصورت یک پلیمر خطی حاوی تعداد زیادی ازطول کامل ژنوم ویروس، تکثیر و بعد از همسانه سازی، تعیین ترادف گردید. مقایسه طول کامل ژنوم 24 جدایه با یکدیگر و با نمونه های موجود در بانک جهانی ژن نشان داد که این جدایه ها از نظر ترادف نوکلئوتیدی69/3تا99/9درصدبه هم شبیه هستند. همچنین، مقایسه ترادف نوکلئوتیدی و آمینواسیدی ژن پروتئین پوششی به ترتیب تشابه 73/6تا100درصدو74تا100درصد رادرمیان این جدایه ها نشان داد نتایج حاصل از این تحقیق نشان میدهد که برخلاف نظرات قبلی، ویروس پیچیدگی برگ شلغم دارای تنوع ژنتیکی نسبتاً بالایی میباشد

Keywords:

ویروس پیچیدگی برگ شلغم , تنوع ژنتیکی , میزبانهای طبیعی , استان فارس