بررسی ساختار ژنومی جدایه های ایرانی بورخولدریامالئی با استفاده از روش آنالیز متکی بر واحدهای پشت سر هم تکرار شونده (VNTR)

رضا نجف پور; نادر مصوری; کیوان تدین; الهه تاج بخش

بررسی ساختار ژنومی جدایه های ایرانی بورخولدریامالئی با استفاده از روش آنالیز متکی بر واحدهای پشت سر هم تکرار شونده (VNTR)

Publish place: The First National Congress of Biology and Natural Sciences of Iran

Publish Year: 1393

Type: Conference paper

Language: Persian

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/333425

Document National Code:

BSCONF01_509

Index date: 4 February 2015

بررسی ساختار ژنومی جدایه های ایرانی بورخولدریامالئی با استفاده از روش آنالیز متکی بر واحدهای پشت سر هم تکرار شونده (VNTR) abstract

مشمشه یکی از مهمترین بیماریهای زئونوز بوده که توسط باکتری بورخولدریا مالئی ایجاد میگردد. یکی از روشهای مولکولی در جهت شناسایی سویه های در گردش و مولکولار اپیدمیولوژی بورخولدریا مالئی استفاده از واحدهای تکرار شونده ژنومی معروف به Tandem repeat میباشد که به دلیل مشاهده تنوع در تعداد آنها در مناطق خاصی از ژنوم سبب شناسایی تنوع در میان سویه های باکتری میگردند. در مطالعه حاضر با استفاده از روش MLVA دو لوکوس پایه به نامهای Bm1367 و Bm140 انتخاب و جهت ارزیابی تکنیک VNTR classic مجدداً طراحی پرایمر و بهینه سازی صورت پذیرفت. از سوی دیگر یک لوکوس جدید نیز به نام Bm41 با کمک نرم افزار Tandem repeat finder طراحی و به مجموعه فوق اضافه گردید. آزمون های PCR در ابتدا به صورت مستقل و سپس هر سه آزمون توسط یک پروتکل واحد فراهم گردید. بعد از توالی یابی محصول PCR شناسایی و تعیین دقیق تعداد تکرارهای ژنتیکی در هر لوکوس با استفاده از نرم افزارهای Tandem Repeat Finder و Clustal X صورت پذیرفت و تنوع ژنتیکی در بین جدایه های مورد مطالعه بررسی و در سه تیپ ژنتیکی قرار گرفت.

بررسی ساختار ژنومی جدایه های ایرانی بورخولدریامالئی با استفاده از روش آنالیز متکی بر واحدهای پشت سر هم تکرار شونده (VNTR) Keywords:

بورخولدریا مالئی , BM 1367 , BM 140 , BM 41 , VNTR

بررسی ساختار ژنومی جدایه های ایرانی بورخولدریامالئی با استفاده از روش آنالیز متکی بر واحدهای پشت سر هم تکرار شونده (VNTR) authors

رضا نجف پور

دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، دانشکده علوم پایه، بخش میکروبیولوژی، شهرکرد، ایران

نادر مصوری

موسسه تحقیقات وسرم سازی رازی، بخش توبرکولین، مالئین و یونین، کرج، ایران

کیوان تدین

موسسه تحقیقات وسرم سازی رازی، بخش واکسنهای هوازی، کرج، ایران

الهه تاج بخش

دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، دانشکده علوم پایه، بخش میکروبیولوژی، شهرکرد، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Taghipour, A., Khaje Nassir, Sh.M., Ghaazi, Marashi., Masoodi Zanjani, S.M, ...

Akbarein, H., Bahonar, AR., Dabbagh Moghaddam, A., Bolouki, Z. Shokouh ...

Zhang, B., Wear, D.J., Kim, H.S., Weina, P., Stojadinovic, A., ...

Janse, I., Hamidjaja, R.A., Hendriks, A.C, and Van Rotterdam, B.J. ...

Coenye, T., and LiPuma, J.J. (2003); Molecular Epidemiology of Bu ...

Hendriksen, . (2010). Global epidemiology of non -typhoidal Salmonella infections ...

Antonov, V.A., Tkachenko, G.A., Altukhova, V.V., Savchenko, S.S., Zinchenko, O.V., ...

Wernery, U., Wernery, R., Joseph, M., AI-Salloom, F., Johnson, B., ...

Carver T, Harris SR, Berriman M, Parkhill J, and McQuillan ...

Untergasser A, Cutcutache I, Koressaar T, Ye J, Faircloth BC, ...

_ Ye J, Coulouris G, Zaretskaya I, Cutcutache I, Rozen ...

McWilliam H, Li W, Uludag M, Squizzato S, Park YM, ...

Naureen, A., Comparative evaluation of Rose Bengal plate agglutination test, ...

Khaki, P., Mosavari, N., Khajeh, NS., Emuam, M., Ahouran, M., ...

Sermswan RW, Wong ratanacheewin S, Tra kulsomboon S, Thamlikitku V: ...

Currie B, Smith -Vaughan H, Golledge C, Buller N, Sriprakash ...

Godoy D, Randle G, Simpson AJ, Aanensen D, Pitt TL, ...

Jana, M., U'Ren, James. Schupp, M., Talima, Pearson., Heidie, Hornstra., ...

Liu Y, Loh JP, Aw L, Yap EP, Lee MA, ...

نمایش کامل مراجع