شناسایی ژن های پپتیدهای حلقوی ضد میکروبی و بررسی بیان آنها در گیاه بنفشه معطر بومی ایران

سیکلوتیدها دسته ای بزرگ از پپتیدهای حلقوی ضد میکروبی هستند که فعالیت های زیستی متنوعی دارند که از آن جمله می توان به فعالیت ضد میکروبی، فعالیت ضد توموری، ضد ویروس نقص ایمنی اکتسابی، آنتاگونیسم نوروتنسین و... اشاره کرد.این دسته از پپتیدهای حلقوی برخلاف پپتیدهای حلقوی جدا شده از میکروارگانیسم ها، که به صورت غیر ریبوزومی سنتز می شوند، به صورت ریبوزومی سنتز شده و دارای ژن کدکننده هستند. در این پژوهش دو جفت پرایمر از مناطق حفاظت شدهتوالی کدکننده سیکلوتیدها، طراحی شد و با انجام واکنش زنجیره ای پلیمراز به شناسایی ژن کدکننده سیکلوتیدها در گیاه بنفشه معطر ایرانی پرداخته شد. پس از بررسی اولیه محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز با ژل الکتروفورز، برای تاییدنهایی، ژن ها توالی یابی شدند. با بررسی توالی ژن های بدست آمده و انجام همترازی توالی های نوکلئوتیدی بومی با به این نتیجه رسیدیم که دو ژن سیکلوتید گیاه بومی ایران به ترتیب 93 % و GenBank توالی های موجود در پایگاه داده این گیاه مشخص شد که از cDNA %89 یکسانی با سایر توالی های کدکننده سیکلوتیدها دارند. همچنین، با بررسی محتوای این دو ژن تنها یک ژن بیان می شود. نتایج تحقیقات ما نشان داد بنفشه معطر ایرانی با توجه به شرایط محیطی پرورش آن، دارای محتوای ژنی متفاوتی در مقایسه با گونه های مشابه در کشورهای دیگر می باشد.

Keywords:

بنفشه معطر ایرانی , پپتیدهای ضد میکروبی , سیکلوتیدها , بیان ژن سیکلوتید