مقایسه رو شهای نرما لسازی و تعیین ژن در داده های میکروآرایه cDNA
Publish place: 7th national biotechnology congress of I.R. iran
Publish Year: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 410
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0546
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
بیان ژن، پدیده ای اساسی در حیات موجودات زنده می باشد. از مهمترین رو شهای تعیین بیان ژن در سطح رونویسی، تکنولوژی میکروآرایه هایcDNAبوده که قادرند بیان ده ها هزار ژ ن را بطور همزمان انداز هگیری کنند. اما آزمایش های میکروآرایه از ابتدا تا تولید داد ههای خام، در معرض تغییرات نامطلوبی بوده که ناشی از بایاس های آزمایشگاهی و تکنیکی هستند. جهت حذف یا حداقل کردن این تغییرات، رو شهای آماری تحت عنوان تکنیک های نرمال سازی با فرضیات آماری و بیولوژیکی متفاوت پیشنهاد شده است. پنج روش نرمال سازی به صورت منفرد و ترکیبی(در کل یازده روش) جهت پردازش مجموعه داد ه یApoAI بر اساس شناسایی هشت ژن دارای تنظیم پایین مقایسه شدند. نتایج آنالیزها نشان داد که روش نرمال سازی twoDloessبه صورت منفرد و ترکیبی با روشmedian بهترین عملکرد را بر روی این مجموعه داد ه ها نشان می دهد. همچنین استفاده از P-valueبه تنهایی نتایج بهتری از کاربرد همزمان P-valueو تغییرات چند برابری(Fold change) در مرحل هی تعیین ژن های با بیان متفاوت( Feature selection) حاصل می کند.
Keywords:
Authors
سمانه فاضلی فارسانی
گروه مهندسی شیمی، دانشگاه فردوسی مشهد،
محمود اخوان مهدوی
گروه مهندسی شیمی، دانشگاه فردوسی مشهد،
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :