بررسی شباهتها و تفاوتهای ساختاری و عملکردی سه توکسین بزرگ کلستریدیومی

Clostridium و Clostridium novyi در گروه باکتریهای کلستریدیومی دسته خاصی از این باکتریها شامل باکتریهایسلولهای پستانداران تاثیر میگذراند. این توکسینها شامل Rho توکسینهایی تولی میکنند که بر روی گیرندههای difficileکلستریدیوم دیفیسیل و آلفا توکسین کلستریدیوم نویی میباشند. سه توکسین مذکور از نظر نوع فعالی ت B و A توکسینهای تشابه بالایی دارند و در بلاست توالی آمینو اسیدی میزان شباهت آنها در تمام توالیهای گزارش شده از تحقیقات مختلف بالای 90 درصد میباشد. در تحقیق حاضر ما به بررسی شباهتهای ساختار عملکردی این سه توکسین پرداختهایم. در مرحله اولو Pfam بررسی شد و سپس آنالیز جزء به جزء توالی توسط expassy توالیها در سایت alignment شباهتها با استفاده ازرا نشان داد و نمودار B و A همولوژی 50 درصدی توالی آلفا توکسین با توکسینها alignment انجام شد. نتیجه CDARTC فیلوژنیک نیز تاییدی بر این بود که این سه توکسین همگی در یک زیرگروه قرار گرفتهاند. توالیهای تکراری مشترک در پایانه سه توکسین و وجود 4 موتیف و خانواده مشترک در سه توکسین از دیگر شباهتهای این سه توکسین میباشد. نتایج نرم افزارنیز وجود یک موتیف خاص در 551 آمینو اسید ابتدایی توکسین آلفا را به اثبات رسان که این موتیف هنوز در CDARTجزء حیاتی برای انجام فعالیت آنزیم آلفا میباشد. بررسی حاضر وجود DXDشناسایییک قالب ساختاری و عملکردی مشترک بین سه توکسین را به اثبات .رساند

Keywords:

CTL , B توکسین , A آلفا توکسین , توکسین