بررسی نقش موتیف N-terminal cxxc در پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین در گیاهان فرا انباشتگر فلزات سنگین و غیر فراانباشتگر با استفاده از بیوانفورماتیک
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 575
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0274
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
چذب و تجمع فلزات سنگین در گیاهان فراانباشتگر و غیر فراانباشتگر متفاوت است که این تفاوت به ساختار پروتئین های موثر در این فرایندها برمی گردد. به همین منظور برای بررسی ساختار پروتئینی پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین در این دو گروه از گیاهان 111 توالی این پمپ در گیاهان فرا انباشتگر و غیر فرا انباشتگر از بانک اطلاعاتی ExPASY گرفته شد و با استفاده از برنامه های بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفت. تعداد موتیف CXXC، فاصله بین موتیف ها، تنوع اسید آمینه ای بعد وقبل از این موتیف ها و سایر خصوصیات پروتئینی این پمپ ها بررسی شد. نتایج نشان دادند که هیچ ارتباطی بین میزان انباشتگری فلزات سنگین و اسید آمینه قبل از موتیف CXXC و میزان نزدیکی بین این موتیف و غشا وجود ندارد. در مقابل مشخص شد که بیشترین اثر روی میزان انباشتگری فلزات سنگین مربوط به تعداد موتیف CXXC در پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین می باشد که در بسیاری از پژوهش های پیشین نیز به نقش تنظیمی این موتیف اشاره شده بود. نتایج نشان دادند که تعداد این موتیف در گیاهان حساس کمتر است در حالی که تعداد بیش از 3موتیف تنها در گیاهان گروه فراانباشتگر و متحمل مشاهده شد. همچنین مشخص شد که فاصله بین موتیف های CXXC در بین گروه های مختلف گیاهان مورد مطالعه متفاوت است.
Keywords:
Authors
الهام اشرفی دهکردی
دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه شیراز، شیراز
عباس عالم زاده
دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه شیراز، شیراز
اسماعیل ابراهیمی
دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه شیراز، شیراز
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :