مطابقت رشته های DNA با استفاده از زبان برنامه نویسی FORTRAN و بر پایه رابط موازی سازی OpenMP
Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 528
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NFBAS01_188
تاریخ نمایه سازی: 30 دی 1394
Abstract:
در این مقاله سعی دارد تا با استفاده از الگوریتم موازی در سطح DNA پروتئین برای مطابقت در رشته های DNA را موردبررسی قرار دهد، و یک الگوریتم جدید به نام کامیت که زاتا یک الگوریتم سریال است را به نحوی که در مقاله به بیانعملکرد آن می پردازد که قسمت های از الگوریتم, را به صورت موازی با رابط موازی سازی OpenMP پیاده سازی کند. تا بااستفاده از آن بتواند مطابقت رشته های DNA در سطح DNA پروتئین از لحاظ زمان اجرای برنامه و Speed-up حاصلاز اجرا آن بروی تعاد پردازنده های متفاوت , نسبت به الگوریتم های دیگری که به حالت ایده آل نزدیک تر باشد را ارائهکند, و اهداف اصلی که از ارائه این مقاله مد نظر است که بتوان ارائه یک روش کارآمد در تطبیق رشته های DNA و بیاناینکه الگوریتم مذبور در زبان برنامه نویسی FORTRAN با رابط موازی سازی OpenMP با چه تعاد پردازنده عملکردبهتری خواهد داشت.
Authors
میلاد قاسمزاده
دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا (ع) مشهد
مهدی مهنانی
دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه آزاد اسلامی واحد مشهد
عبدالرضا سوادی
استادیار دانشگاه فردوسی مشهد
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :