تکامل مولکولی خانواده ژنی هومئوباکس

ژن های هومئوباکس یک گروه بزرگ و متنوع از ژن ها هستند که بیشتر آنها به عنوان عوامل رونویسی عمل می نمایند. توالی های هومئوباکس شامل 180 جفت باز یا بیشتر می باشد که پپتیدهای هومئودمین را کدگذاری می کنند. ژن های هومئوباکس در یوکاریوت ها یافت می شوند. ژن های هومئوباکس نقش اساسی در ویژگی های هویتی سلول ها و همچنین در رشد محور بدنی خلفی و قدامی در جنین های حیوانات با تقارن دوطرفه نقش دارند. بسیاری دیگر از ژن های هومئوباکس نقش های کلیدی در رشد جانور از طریق به کار گیری ژن های هومئوباکس در رشد مغز به سیستم عصبی مرکزی، استخوان ها، ماهیچه ها، قلب، کبد، و بخش های دیگر بدن را دارند. دارای 12 کلاس می باشند که در آنها بیش از 100 ژن وجود دارد. روشها: مراحل کار جهت ارتباط تکاملی خانواده ی ژنی هومئوباکس شامل استخراج توالی RNA ، DNA و Protein می باشد. هر یک از اعضای این خانواده ژنی را با مراجعه به پایگاههای اطلاعاتی بیوانفورماتیک مانند BLAST انجام می کنیم. مرحله ی بعد پس از بدست آوردن توالی ها آنها را با روش Multiple Sequence Alignment انطباق چند گانه می دهیم تا بتوانیم به موتیف ها و دمین های مهم و مشابه در آنها که دراحتمالا جهش در آنها در ایجاد بیماری نقش دارند پی ببریم. مرحله ی چهارم رسم درخت فیلوژنتیکی به منظور بررسی به روابط تکاملی Homeobox می باشد. در مرحله بعدی با طراحی یک برنامه رایانه ای به جستجوی موتیفها در توالی ها می پردازیم .

Keywords:

ابزارهای بیوانفورماتیکی , درخت فیلوژنتیکی , NCBI , BLAST