اولین گزارش کاربرد نشانگر مولکولی TRAP و سیستم الکتروفورز ژل عمودی پلی اکریلامید بهینه و مقرون به صرفه با رنگ آمیزی اتیدیوم بروماید در بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های آفتابگردان
Publish place: The first international conference and the fourth national conference on medicinal plants and sustainable agriculture
Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 830
This Paper With 18 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
MPSA04_079
تاریخ نمایه سازی: 9 فروردین 1395
Abstract:
نشانگر مولکولی جدید Target Region Amplification Polymorphism TRAP برای اولین بار در آفتاب گردان در سال 2003 کشف شد در این نشانگر از یک آغازگر ثابت طراحی شده برای توالی بیان شده برچسب دار Expressed Sequence Tag-EST و یک آغازگر تصادفی برای ایجاد نشانگر چند شکل در اطراف توالی های ژن کاندیدای هدف استفاده می شود این نشانگر بین 30-50 قطعه چند شکل ایجاد می کند و به این دلیل جزو نشانگرهای با درجه چند شکلی بالا به شمار می رود با وجود 12 سال از معرفی این نشانگر هنوز گزارشی در مورد استفاده از آن برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در آفتابگردان و حتی سایر گیاهان در کشور وجود ندارد از طرف دیگر در بسیاری از آنالیزهای مولکولی نظیر نشانگرهای مولکولی و انگشت نگاری ژنتیکی ژنوتیپ ها تعداد زیاد نمونه های آزمایشی باعث دشواری کار و صرف هزینه ساخت ژل های متعدد و همچنین صرف زمان زیاد برای انجام آزمایش می باشد در این تحقیق برای بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگر TRAP از روش جدید الکتروفورز ژل پلی اکریلامید با استفاده از رنگ امیزی اتیدییوم بروماید استفاده شده که نسبت به روش های رنگ آمیزی نقره و نشاندار کردن آغازگر ها با فلورسنت دارای مزیتهای همچون مقرون به صرفه بودن سرعت بالای آنالیز حجم بالای 196 نمونه ای در هر ازمایش و همچنین استفاده مجدد از ژل ها می باشد نتایج نشان داد که 19 ترکیب آغازگری در مجموع 116 باند ایجاد کردند که 109 تای آنها چند شکل بود محتوای اطلاعات چند شکل این نشانگر بین 0/03 و0/5 و میانگین 0/33 نشان داد که به عنوان یک نشانگر قدرتمند با چند شکلی بالا می تواند در بررسی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم آفتابگردان مورد استفاده قرار گیرد
Keywords:
Authors
حسین زینل زاده تبریزی
پژوهشگر جهاد دانشگاهی همدان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :