مدل سازی شبکه های تنظیمی ژنی با استفاده از آنتولوژی ژن و شبکه های بیزین
Publish place: 16th Iranian Conference on Electric Engineering
Publish Year: 1387
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 4,550
This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICEE16_091
تاریخ نمایه سازی: 6 اسفند 1386
Abstract:
پروتئین ها محصولات نهایی ژنها طی یک فرایند پیچیده می باشند. علاوه بر خواص مجزای هر ژن، تعاملات بین ژنها، پروتئین ها و مواد دیگر در سلول، تشکیل یک شبکه پیچیده می دهند و نقش مهمی در عملکرد درست سلول بازی می کنند. برای فهم نحوه ی عملکرد یک ارگانیسم باید بدانیم کدام ژنها، با چه سرعتی و در چه زمانی بیان می شوند. با استفاده از مدل سازی شبکه های ژنی می توان اعمال سلولی را در سطح مولکولی تشریح کرد. روش آزمایشگاهی میکرو آرایه های DNA امکان اندازه گیری همزمان بیان هزاران ژن را فراهم می کنند. به دلیل نویزی بودن داده های میکرو آرایه و طبیعت احتمالاتی شبکه های بیزین و لذا توانایی آنها در کار با این گونه داده ها، در این مقاله از این شبکه برای مدل سازی روابط علی میان ژنها استفاده شده است. یک مسئله اساسی در مورد یادگیری شبکه های بیزین در این زمینه، فضای جستجوی بسیار بزرگ و تعداد کم نمونه ها است؛ لذا در این کار از خوشه بندی ژن ها بر اساس اطلاعات بیولوژیکی موجود (انتولوژی ژن) و محاسبه ی همبستگی بین پروفایل های بیان ژنهای هم خوشه، برای کاهش فشای جستجو استفاده شده است. نتایج به دست آمده بر روی داده های سری زمانی مربوط به چرخه سلولی مخمر (Yeast) نشان می دهند که روش ارایه شده، توانایی شبکه بیزیم را در تشخیص روابط درست بهبود می دهد.
Keywords:
Authors
فاطمه یاوری
دانشکده مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی امیرکبیر
فرزاد توحید خواه
دانشکده مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی امیرکبیر
شهریار غریب زاده
دانشکده مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی امیرکبیر
علیرضا خان تیموری
دانشکده مهندسی کامپیوتر دانشگاه صنعتی امیرکبیر
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :