بررسی برهمکنش داروی ایندومتاسین با پروتئین آلبومین سرم انسانی با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی و مقایسه آن با نتایج تجربی

در این تحقیق با بررسی برهمکنش داروی ایندومتاسین با پروتئین آلبومین سرم انسانی با استفاده از روش محاسباتی شبیه سازی دینامیک مولکولی و کالریمتری تیتراسیونی هم دما، میزان پایداری و تغییرات ساختاری پروتئین مورد مطالعه قرار داده شده است. با استفاده از روش کالریمتری تیتراسیونی هم دما میزان ثابت اتصال برای تشکیل کمپلکس آلبومین سرم انسانی با ایندومتاسین k= 9.12×10 -3 بدست آمد. شبیه سازی دینامیک مولکولی به کمک نرم افزار گرومکس با نسخه 4.6.1 بر روی ساختار کریستالی آلبومین سرم انسانی که حاوی دو مولکول ایندومتاسین بود، انجام شد. پارامترهای ترمودینامیکی از جمله انرژی آزاد اتصال دارو به پروتئین، برای هر دو مولکول بدست آمد، که منفی تر بودن مقدار انرژی آزاد اتصال مولکول دوم واقع در زیر دومین IIA نسبت به مولکول اول واقع در زیر دومین IB نشان میدهد که این اتصال پایدارتر بوده و نقش مهمتری را در مطالعه برهمکنش داروی ایندومتاسین با پروتئین آلبومین سرم انسانی خواهد داشت. همچنین این نتایج در توافق خوبی با نتایج حاصل از کالریمتری تیتراسیونی همدما می باشد.

Keywords:

آلبومین سرم انسانی , ایندومتاسین , شبیه سازی دینامیک مولکولی , کالریمتری تیتراسیونی هم دما