با کم و بیش اختلاف نظر، بر سر وضع نامطلوب پژوهشی در کشور و آسیب دیدن و آفت زده شدن آن اتفاق نظر هست. در بررسی وضع پژوهش و آسیب شناسی آن و همچنین ارایه راهکار، استفاده از منابع اصیل قرآن و عترت نکته ای است که در این نوشته به آن متمسک شده ایم. در این جا آفت اصلی پژوهشی جدی نگرفتن اخلاص در آن عنوان شده است. اخلاص در عمل در امور فنی و مربوط به فنا وری همانند دیگر موارد شاه کلید رهایی از تباهی و رشد و بالندگی است. در مقابل عمل مشرکانه، سرچشمه تباهی ها است و شروع تباهی اش در نیت رخ می دهد. شرح داده شده است که عمل مشرکانه، توسط شیطان آراسته و ظاهرسازی می شود، و فریب نخوردن، مراقبتی فوق العاده می طلبد. اعضای جامعه دانشگاهی به وفور در معرض مصداق های موارد ذکر شده (که در این مقاله چندتایی از آنها برشمرده می شود) می باشند. در ابتدا باید راهکارهای سلبی برآمده از منابع اصیل به جد مورد توجه قرار گیرد که عمدتا اصلاح قوانین و مقررات با از بین بردن قسمت ها و روندهای سوق دهنده به شرک است. پس از آن است که راهکارهای ایجابی درست تشخیص داده شده و به مرحله اجرا می رسند. تعدادی از این راهکارها در این مقاله ارایه شده اند.