اثر ناهمسانگردیِ مقطع، بر شکل سه بعدی حلقه های کوچک DNA

در این پژوهش شکل سه بعدیِ تعادلی، برای طول های کوتاهی از DNA مورد مطالعه قرار می گیرد. از یک مدل کشسان که ناهمسانگردی مقطع DNA را در مدول های سختی در نظر گرفته است استفاده می کنیم. با در نظر گرفتن یک ناهمسانگردیِ قابل قبول که از مطالعات شبیه سازیِ مولکولی به دست آمده است، مشاهده می کنیم که DNA حلقوی شده با طول هایی که مضرب صحیحی از پای پیچ آن نیستند؛ شکل هایی غیر بدیهی به وجود می آورد که شامل تاخوردگی هایی به بیرون ز صفحه و تشکیل شکستگی می شود. همچنین اثر ناهمگون بودن توالی ژن ها نیز مطالعه شده، و نشان داده ایم که این عامل باعث پررنگ تر شدن اثرات هندسی روی DNA یشود. این نتایج می تواند به درک بهتر برهمکنش DNA با پروتئین ها و RNA کمک کند.