جایگاه تاکسونومیکی ایرانی ویروس موزاییک کدو براساس ترادف ژن CP

ویروس موازییک SqMV یکی از ویروس های مهم آلوده کننده گیاهان خانواده کدو در جهان می باشد این ویروس از خانواده Sequviridae و جنس Comovirus بوده، ژنوم آن شامل دو قطعه RNA تک رشته ای مثبت می باشد به منظور بررسی مولکولی و تعیین جایگاه تاکسونومیکی جدایه ایرانی SqMV در طی ماه های فروردین تا خرداد ماه 1392 تعداد 168 نمونه گیاهی از مزارع کدو، خربزه و هندوانه واقع در دو استان خراسان جنوبی و رضوی جمع آوری گردید. آلودگی نمونه های موردنظر در ابتدا توسط روش RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی مورد بررسی قرار گرفت. از این میان، 10 نمونه آلوده به ویروس موزاییک کدو تشخیص داده شدند. دو نمونه ا زاستان خراسان جنوبی بیرجند و قاین انتخاب گردیده، پس از همسانه سازی، تعیین ترادف شدند. جهت تعیین جایگاه تکاملی این دو جدایه در مقایسه با جدایه های مختلف دنیا درخت فیلوژنتیکی توسط نرم افزار MEGA رسم گردیدو نتایج حاصله بیانگر آن بود ک براساس مقایسه ترادف نوکلیوتیدی جدایه های ایرانی بیرجند و قاین بیشترین درصد تشابه را به جدایه های از کشور اسپانیا دارند.

Keywords:

ویروس موزاییک کدو , روش RT-PCR , خراسان