بررسی تنوع ژنتیکی برخی از ارقام تجاری سیب (Malus domestica L.) در استان خراسان رضوی با استفاده از فناوری RAPD-PCR

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 671

This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-11-1_006

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

Abstract:

هدف: هدف از این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی ارقام تجاری سیب در استان خراسان رضوی با استفاده از 40 آغازگر RAPD بود. مواد و روش ها: DNA از برگهای جوان درخت سیب جمع آوری و با استفاده از روش دلاپورتا استخراج شد. به منظور بررسی چندشکلی، واکنش زنجیره ای پلیمراز برای هر آغازگر انجام و شاخص های نشانگری محاسبه شدند. تشابه ژنتیکی و گروه بندی نمونه ها به ترتیب بر اساس ضریب تشابه جاکارد و روش UPGMA و تجزیه PcoA به کمک نرم افزارNTSYS-PC  نسخه 2.2 انجام شد. ساختار ژنتیکی جمعیت سیب مورد مطالعه نیز با استفاده از نرم افزار STRUCTURE نسخه 2.3 ارزیابی شد. نتایج: بر اساس نتایج بدست آمده، بیشترین باند چندشکل متعلق به آغازگر OPA7 و کمترین باند چندشکل مربوط به آغازگر OPJ13 بود. بیشترین و کمترین میزان PIC به ترتیب در آغازگرهای OPA4 (48/0) و OPM6 (2/0) دیده شد. طبق نتایج تجزیه کلاستر با روش UPGMA، ارقام مورد نظر در 2 گروه اصلی و 5 زیرگروه دسته بندی شدند. بیشترین تشابه بین ارقام گلاب اصفهان-گلمکانی، Margenduft-Low Red Roem Beauty  و علیموری خراسان-Dalago و کمترین تشابه بین ارقام گلاب اصفهان- Fuji Rossa و گلاب اصفهان-Low Red Roem Beauty  تشخیص داده شد. گروه بندی نمونه های سیب بر اساس تجزیه PcoA و روش UPGMA متفاوت بود. به علاوه، نتایج بدست آمده از آنالیز Bayesian بیانگر عدم اختلاط تبار ارقام سیب مورد مطالعه بود. نتیجه گیری: بر اساس نتایج به دست آمده از این تحقیق، می توان از نشانگر RAPD در شناسایی نواحی چندشکلی، تخمین فاصله ژنتیکی و مدیریت ژنوتیپ و ارقام سیب استفاده کرد.

Authors

مهیار گرامی

استادیار، موسسه آموزش عالی غیرانتفاعی سنا، ساری، ایران

محمود رضا کریمی شهری

بخش گیاهپزشکی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی، مشهد، ایران

پرستو مجیدیان

گروه اصلاح نباتات، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منایع طبیعی مازندران

سمیه حیدری شرفدار کلاهی

دانشکده غیرانتفاعی سنا، ساری، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Botstein D, White RL, Skolnick M, Davis RW (1980) Construction ...
  • Dar JA, Wani AA, Dhar MK (2017) Assessment of the ...
  • Dellaporta SL, Wood J, Hicks JB (1983) A plant DNA ...
  • Dunemann F, Kahnau R, Schmidt H (1994) Genetic relationships in ...
  • Fagoria GL, Ranwah BR, Saharan V (2013) Diversity analysis in ...
  • Farrokhi J, Darvishzadeh R, Naseri L et al. (2011) Evaluation ...
  • FAOSTAT (2017). http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC/visualize. ...
  • Gasi F, Simon S, Pojskic N et al. (2013) Evaluation ...
  • Goulao L, Oliveira CM (2001) Molecular characterisation of cultivars of ...
  • Govindaraj M, Vetriventhan M, Srinivasan M (2015) Importance of genetic ...
  • Guimaraes JFR, Nietsche S, Costa MR et al. (2014) Genetic ...
  • Jarausch W, Saillard C, Helliot B et al. (2000) Genetic ...
  • Karimi MR, Dehvari V, Hajiyan M (2011) Genetics diversity of ...
  • Kenis K, Keulemans J (2005) Genetic linkage maps of two ...
  • Larsen B, Toldam-Andersen TB, Pedersen C, Ørgaard M (2017) Unravelling ...
  • Mokhtarian PL, Van Herick D (2016) Quantifying residential self-selection effects: ...
  • Odong TL, Van Heerwaarden J, Jansen J et al. (2011) ...
  • Okcu M, Kalkışım Ö, Okcu Z et al. (2015) Determination ...
  • Omasheva ME, Pozharsky AS, Smailov BB et al. (2018) Genetic ...
  • Oraguzie NC, Gardiner SE, Basset HC et al. (2001) Genetic ...
  • Patzak J, Paprštein F, Henychová A, Sedlák J (2012) Comparison ...
  • Pereira‐Lorenzo S, Urrestarazu J, Ramos‐Cabrer AM et al. (2017) Analysis ...
  • Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (2000) Inference of population ...
  • Roche P, Alston FH, Maliepaard C et al. (1997) RFLP ...
  • Roldan-Ruiz I, Dendauw J, Van Bockstaele E et al. (2000) ...
  • Savelyeva EN, Kudryavtsev AM (2015) AFLP analysis of genetic diversity ...
  • Soengas P, Velasco P, Padilla G et al. (2006) Genetic ...
  • Urrestarazu J, Denancé C, Ravon E et al. (2016) Analysis ...
  • Velasco R, Zharkikh A, Affourtit J et al. (2010) The ...
  • نمایش کامل مراجع