کاربرد الگوریتم uMelt SM در آنالیز منحنی ذوب Real-time PCR
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 10، Issue: 2
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 599
This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JOAGK-10-2_003
Index date: 10 June 2019
کاربرد الگوریتم uMelt SM در آنالیز منحنی ذوب Real-time PCR abstract
یکی از چالشهای موجود در تفسیر نتایج qPCR ، اطمینان از اختصاصی بودن قطعات تکثیر شده است که برای بررسی آن از آنالیز منحنی ذوب استفاده میشود. پیکهای اضافی در منحنی ذوب همیشه نشان دهنده یک مشکل نیست، به همین منظور در این مقاله یک ابزار مبتنی بر وب به نام uMelt SM به عنوان راهکاری کاربردی و ساده برای آنالیز صحیح منحنی ذوب به محققین پیشنهاد میگردد که امکان پیشبینی منحنی ذوب DNA و پروفیلهای واسرشته سازی را با وضوح بالای فلورسنت از محصولات PCR فراهم میکند. نتایج این مطالعه نشان داد که منحنیهای ذوب براساس چه پارامترهایی تولید شده و الگوریتم مناسب برای نحوه کار با این نرم افزار ارائه گردید. در نهایت ژنهای اکتین و سوپراکسید دیسموتاز از قارچ Pyricularia oryzae به عنوان الگوی مناسب برای تعیین منحنی پیشبینی شده با استفاده از این نرمافزار ارائه گردید و منحنی Real-time PCR نیز ترسیم شد. براساس نتایج منحنی ذوب با استفاده از نرم افزار uMelt SM در مقایسه با منحنی ذوب دستگاه Real-Time PCR تطابق بالایی را نشان میدهد که این نتایج تاییدی بر مزیتهایی همچون سهولت استفاده، صرفهجویی در زمان، هزینه و تلاش در بخش تجربی با استفاده از این نرمافزار میباشد.
کاربرد الگوریتم uMelt SM در آنالیز منحنی ذوب Real-time PCR Keywords:
کاربرد الگوریتم uMelt SM در آنالیز منحنی ذوب Real-time PCR authors
اناهیتا خارابی ماسوله
دانش آموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه علوم گیاهی و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران.
عباس سعیدی
هیئت علمی موسسه ملی گیاهان زینتی (NIOP)، تحقیقات باغبانی علوم، تحقیقات کشاورزی، آموزش و توسعه، محلات، ایران.
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :