تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی بخشی ازناحیه کنترلی ژنوم میتوکندری در گوسفند زندی

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 418

This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-9-3_002

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

Abstract:

حفظ دام­های بومی، به عنوان ذخایر ژنتیکی و سرمایه­های ملی برای برنامه­های اصلاح نژادی و  بازده تولید ضروری می­باشد. استفاده از نشانگرهای ژنتیکی توالی یابی ژنوم میتوکندری یکی از کاربردی ترین روش­ها برای تشخیص گونه­ها و تعیین رابطه فیلوژنی بین جمعیت­ها و گونه­های نزدیک به هم می­باشد. هدف از این مطالعه بررسی میزان تنوع ناحیهHVR-I  ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد زندی بود. بدین منظور نمونه­های خون از تعداد 25 راس گوسفند غیر خویشاوند نژاد زندی در ایستگاه خجیر تهران جمع­آوری شد؛ و پس از استخراج DNAوتکثیر قطعه 432 نوکلئوتیدی ناحیه HVR-I ژنوم میتوکندری با استفاده از واکنش زنجیره­ای پلیمراز، نمونه­ها توالی یابی شدند. نتایج آنالیز توالی­ها حاکی از وجود چهار هاپلوتایپ و چهار جایگاه چند شکل در ژن مذکور بود. بررسی همولوژی توالی مورد توافق انواع نژادهای گوسفند نشان داد که تثبیت چند شکلی موجود در موقعیت شماره 13 نمونه های بررسی شده به عنوان جامعه­ای کوچک از گوسفندان زندی ایران ممکن است فقط خاص گوسفند نژاد زندی ­باشد. بررسی تنوع نوکلئوتیدی نشان داد که گوسفند نژاد زندی دارای تنوع نوکلئوتیدی کمتری نسسبت به گوسفندان مغانی و بلوچی می­باشد. نتایج ترسیم درخت فیلوژنی نشان داد که گوسفند نژاد زندی متعلق به گروه هاپلوتایپی A می­باشد و کمترین فاصله ژنتیکی را با نژادهای گوسفند ایرانی بلوچی، مغانی و افشاری دارد، با این وجود فاصله ژنتیکی  قابل تاملی را با توالی مرجع گروه هاپلوتایپی A دارا می­باشد.

Authors

زانا پیرخضرانیان

دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.

محمد رزم کبیر

استادیار گروه ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران.

نرگس نظیفی

دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • DiMauro S (2004). Mitochondrial diseases.BiochimicaetBiophysicaActa 1658:80-88. ...
  • Excoffier L, Laval G, Schneider S (2005). Arlequin (version 3.0): ...
  • Guo J, Du LX, Ma YH, Guan WJ, Li HB, ...
  • Hall TA (1999). BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor ...
  • Hiendleder S, Kaupe B, Wassmuth R, Janke A (2002). Molecular ...
  • Hiendleder S, Lewalski H, Wassmuth R, Janke A (1998). The ...
  • Javanmard A, Mohammadabadi MR, Zarrigabayi GE, Gharahedaghi AA, Nassiry MR, ...
  • Jazin E, SoodyallH, Jalonen P, Lindholm E, Stoneking M, Gyllensten ...
  • Khodabakhshzadeh R, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh Koshkoieh A, Moradi-Shahrebabak H, Ansari ...
  • Khodabakhshzadeh R, Mohammadabadi MR, Moradi H, Esmailizadeh AK, Ansari NS ...
  • Khodabakhshzadeh R, Mohammadabadi MR, Moradi-Shahrebabak H, EsmailizadehKoshkoieh A (2016a). Identification ...
  • Khodabakhshzadeh R., Mohammadabadi MR, EsmailizadehKoshkoieh A, Moradi-Shahrebabak H, Bordbar F, ...
  • Knudsen B, Knudsen T, Flensborg M, Sandmann H, Heltzen M, ...
  • Lalitha S (2000). Primer premier 5. Biotech Software & Internet ...
  • Mohammadabadi MR, Sattayimokhtari R (2013). Estimation of (co) variance components ...
  • Mohammadhashemi A (2009). Sequencing of HVR1 region of mtDNA in ...
  • Mohammadi A, Nassiry MR, Mosafer J, Mohammadabadi MR, Sulimova GE ...
  • Mohammadipestebik F, Pirany N, Shojaa J, Mohammadhashemi A (2011). Determination ...
  • Mousavizadeh A, Mohammadabadi MR, Torabi A, Nassiry MR, Ghiasi, Esmailizadeh ...
  • Naghash H, Naderi S, Taberlet P (2007). Large-Scale Mitochondrial DNA ...
  • Nass S, Nass MM (1963). Intramitochondrial fibers with DNA characteristics ...
  • Nei M (1987). Molecular evolutionary genetics: Columbia University Press. ...
  • Pardeshi V, Kadoo N, Sainani M, Meadows J, Kijas J, ...
  • Parvari R, Avivi A, Lentner F, Ziv E, Telor, Burstein ...
  • Pirani N, Mohammadhashemi A, Alijani S, Rezazadeh R, Ghanbari S ...
  • Pirkhezranian Z, Tahmoorespour M, Mohammadhashemi A, Pirani N, Azghandi. M ...
  • Shafaqmotlagh A (2007). Determination the mtDNA D- loop Sequence in ...
  • Soufy B, Mohammadabadi MR, Shojaeyan K, Baghizadeh A, Ferasaty S, ...
  • Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, ...
  • Tapio M, Marzanov N, Ozerov M, Ćinkulov M, Gonzarenko G, ...
  • Technelysium PL (2007). Chromas lite version 2.01. ...
  • Valizade R, Nassiry MR, Sadeghi B, Ghovati Sh, Javadmanesh A ...
  • Wood N, Phua S (1996). Variation in the control region ...
  • Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR (2015). Associations of Inter-Simple ...
  • Zeder MA, Emshwiller E, Smith BD, Bradley DG (2006). Documenting ...
  • نمایش کامل مراجع