بررسی توالی و ساختار مرکزی در ساختمان الکل دهیدروژنازها
Publish place: Journal of Applied Biology، Vol: 30، Issue: 2
Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 506
This Paper With 19 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JAB-30-2_008
تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398
Abstract:
با هدف بررسی و شناسایی اسیدهای آمینه مهم از نظر ساختاری و عملکردی در خانواده الکل دهیدروژنازها که در طول تکامل محافظت شده اند، تجزیه و تحلیل کامپیوتری پیشرفته ای بر روی توالی و ساختار سه بعدی این آنزیم ها انجام شد. آنالیزتوالی با توجه به برخی خصوصیات اسیدهای آمینه از جمله همسانی، تشابه، انتروپی، هیدروفوبیسیتی برای تعیین سطح محافظت شدگی در هر جایگاه انجام گرفت. بر اساس محاسبات انجام شده، مناطق بسیار محافظت شده ای در ساختار و توالی الکل دهیدروژنازها شناسایی شدند. با آنالیز بیشتر توالی ها و جایگاه های محافظت شده، معلوم شد که در این مناطق، خصوصیات مشترکی مشاهده می شود. نتایج محاسبات در این مطالعه نشان داد که این امکان وجود دارد که در جایگاه های ویژه ای از ساختار این آنزیم، الگوهای محافظت شده خاصی تعریف شود و بر آن اساس، پایداری ساختاری آنزیم که عامل غلبگی آن در طول تکامل است را توجیه کند. در این مطالعه دو منطقه کاملا محافظت شده که الگوی مشخصی را در توالی خود در طول تکامل حفظ کرده اند، مشخص شدند. به نظر می رسد این موتیف ها در تغییر آرایش فضایی آنزیم بعد از اتصال به سوبسترا یک نقش مکانیکی به عنوان لولا داشته باشند.
Keywords:
Authors
شمیلا درویش علیپورآستانه
استادیار/پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
زرین مینوچهر
استادیار/پژوهشگاه ملی و مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
آرمین مددکار سبحانی
استادیار/دانشگاه تهران
مهران میراولیایی
دانشیار/دانشگاه اصفهان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :