بررسی اثراتSNPغیر مترادف در اگزون شماره 2 ژن 15BMP گوسفندان عربی و بهمئی بر ساختار و عملکرد پروتئین با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی

روش ژن کاندیدا و استفاده از نشانگرهای ژنتیکی، روش جدید برای بهبود صفت چندقلوزایی در گوسفند می باشند. چندقلوزایی یکی از صفات مهم اقتصادی در پرورش گوسفند و بز می باشد. به کارگیری روش های سنتی اصلاح نژاد نظیر انتخاب و آمیزش بر اساس داده های فنوتیپی، دارای روند کند و پرهزینه است. مطالعات ژنتیکی مشخص نموده است که نرخ تخمک ریزی به وسیله ی مجموعه هایی از ژن هایی با اثر عمده به نام ژن های باروری کنترل می شوند. با توجه به اهمیت چندقلوزایی، در این پژوهش، وجود جهش های جدید در ژن BMP15 در نژاد گوسفندان عربی و بهمئی بررسی شد. نمونه های خون از تعداد 50 راس گوسفند عربی ایستگاه تحقیقاتی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان و 35 راس گوسفند بهمئی از ایستگاه تحقیقاتی بهمئی جمع آوری شد. پس از استخراج DNA، یک قطعه 864 جفت بازی از اگزون شماره 2 ژن BMP15 تکثیر شد. سپس نمونه ها با کمک شرکت BIONEER کره جنوبی توالی یابی شدند. توالی ای بدست آمده توسط نرم افزار bio Edit پردازش و با کمک وب سایت NCBI بلاست گردید. در نژاد بهمئی تغییر نوکلئوتیدی در ژن BMP15 مشاهده نگردید اما در نژاد عربی یک جهش جایگزینی گوانین (G) به جای سیتوزین (C) رخ داده است که این جهش سبب تغییر اسیدآمینه پرولین به اسیدآمینه آلانین می گردد. این موضوع سبب تغییر در ساختار سوم پروتئین می شود.