آنالیز فیلوژنتیک جدایه های کاپری پاکس ایران طی سال های 1392-1395
Publish place: Veterinary Research & Biological Products، Vol: 32، Issue: 1
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 463
This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_VTJ-32-1_001
Index date: 3 July 2019
آنالیز فیلوژنتیک جدایه های کاپری پاکس ایران طی سال های 1392-1395 abstract
جنس کاپری پاکس ویروس ازخانواده پاکس ویریده شامل سه ویروس آبله گوسفند (SPV)، آبله بز (GPV) و لامپی اسکین (LSDV) می باشد که خسارات اقتصادی مهمی به دامداری در مناطق اندمیک وارد کرده اند. از انجایی که کاپری پاکس ویروس ها از لحاظ مورفولوژی و آنتی ژنیکی مشابه هستند، تفریق این ویروس ها بر استفاده از روش های مولکولی متکی است. هدف از این مطالعه تشخیص مولکولی کاپری پاکس ویروس های ایران براساس آنالیز سکانس ژن همولوگ گیرنده کموکاین می باشد. به این منظور، 16 ایزوله کاپری پاکس شامل 10 ایزوله SPV، 4 ایزوله GPV و 2 ایزوله LSDV از نقاط مختلف ایران که در سال های 1395-1392 جداسازی شده اند مورد استفاده قرار گرفت. ژن CKR جدایه ها با روش PCR تکثیر شد و در وکتور pTZ57R/T کلون گردید. آن ها در مقایسه با نمونه های CaPV موجود در بانک داده ها توالی یابی شده و آنالیز گردیدند. آنالیز توالی و فیلوژنتیک نشان می دهد که، SPVهای ایران با بیش از 99 درصد تشابه با دیگر SPV های موجود در بانک ژن در یک دسته قرار می گیرند به استثناء SPV عمان. ایزوله های GPV ایران با 99-98 درصد تشابه با دیگر ایزوله های موجود در بانک ژن در یک دسته قرار می گیرند و به علاوه، با ایزوله های GPV هند و بنگلادش پروفایل ژنی مشابهی را نشان می دهند. ایزوله های LSDV ایران 100-99 درصد مشابه دیگر ایزوله های LSDV بانک ژن و در یک دسته قرار گرفته اند. به طور قطع، براساس آنالیز سکانس ژن CKR ایزوله های SPV، GPV و LSD ایران کاملا متفاوت هستند.
آنالیز فیلوژنتیک جدایه های کاپری پاکس ایران طی سال های 1392-1395 Keywords:
آنالیز فیلوژنتیک جدایه های کاپری پاکس ایران طی سال های 1392-1395 authors
ارزو کریم پور صومعه دل
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کرج، ایران
حمیدرضا ورشویی
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کرج، ایران
خسرو آقایی پور
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کرج، ایران
زینب هدایتی
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کرج، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :