استفاده از آنالیز به روش (Single Nucleotide Polymorphism (SNP به عنوان یک راهبرد بررسی ژنتیکی در مطالعات پاراتوبرکولوزیس در ایران

محمد جانمحمدلو; کیوان تدین; اسماعیل اصلی دلفانی

استفاده از آنالیز به روش (Single Nucleotide Polymorphism (SNP به عنوان یک راهبرد بررسی ژنتیکی در مطالعات پاراتوبرکولوزیس در ایران

Publish place: Veterinary Research & Biological Products، Vol: 32، Issue: 1

Publish Year: 1397

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/886466

Document National Code:

JR_VTJ-32-1_006

Index date: 3 July 2019

استفاده از آنالیز به روش (Single Nucleotide Polymorphism (SNP به عنوان یک راهبرد بررسی ژنتیکی در مطالعات پاراتوبرکولوزیس در ایران abstract

ژنوتایپینگ مایکوباکتریوم ایویوم زیرگونه پاراتوبرکولوزیس (MAP) حتی با وجود دسترسی به تکنیک های مولکولی متعارفی نظیر PFGE, RFLP, SSR and MIRU-VNTR همچنان به عنوان یک چالش محسوب می گردد بدان سبب که این باکتری از نظر ژنتیکی بسیار یکنواخت و همگن می باشد. به نظر می رسد که در شرایط امروزی پاراتوبرکولوزیس در سراسر ایران انتشار یافته است چرا که گزارشات مربوط به وقوع بیماری در گله های گاو گوسفند و بز بصورت فزاینده در هر سال انتشار می یابند. میزان اطلاعات موجود از ساختار جمعیت این باکتری در ایران محدود می باشد. یافته های موجود حاکی از فعالیت جدایه های متعلق به تیپ معروف به گاوی می باشند و این در حالی است که تاکنون نشانه ای از وجود تیپ گوسفندی در ایران یافت نشده است. در این تحقیق یک سیستم ژنوتایپینگ (Single Nucleotide Polymorphism (SNP متشکل از 13 لوکوس و با اتکا به PCR بر روی یک جدایه بومی MAP اجرا گردید. آزمون به گونه ای انجام گردید که از یک پروتکل واحد PCR برای همه لوکوس ها استفاده شد. محصولات تکثیر DNA به روش Sanger تعیین توالی شدند. نوکلئوتیدهای هدف تعیین و شناسایی گردیدند. این نوکلئوتیدها بطور کامل با نوکلئوتیدهای هم ارز در ژنوم سویه آزمایشگاهی MAP K10 مطابقت داشتند و هویت جدایه ایرانی را به عنوان جدایه تیپ گاوی نشان دادند. ما معتقدیم اگر روش SNP معرفی شده توسط Leao در مقیاس گسترده در ایران بکار گرفته شود امکان دستیابی به دانش جامع تر از اتفاقات و جریانات تکاملی که وقوع آنها وضعیت اپیدمیولوژیک امروز پاراتوبرکولوزیس در ایران را شکل داده اند، فراهم گردید.

استفاده از آنالیز به روش (Single Nucleotide Polymorphism (SNP به عنوان یک راهبرد بررسی ژنتیکی در مطالعات پاراتوبرکولوزیس در ایران Keywords:

مایکوباکتریوم ایویوم زیرگونه پاراتوبرکولوزیس , SNP , جدایه , اپیدمیولوژی

استفاده از آنالیز به روش (Single Nucleotide Polymorphism (SNP به عنوان یک راهبرد بررسی ژنتیکی در مطالعات پاراتوبرکولوزیس در ایران authors

محمد جانمحمدلو

دپارتمان میکروبیولوژی، دانشکده علوم، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی، کرج، ایران

کیوان تدین

موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی،سازمان تحقیقات، ترویج و آموزش کشاورزی، کرج، ایران

اسماعیل اصلی دلفانی

دپارتمان میکروبیولوژی، دانشکده علوم، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی، کرج، ایران و موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی،سازمان تحقیقات، ترویج و آموزش کشاورزی، کرج، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Achtman M. 2008. Evolution, population structure, and phylogeography of genetically ...

Ahlstrom C., H.W. Barkema, K. Stevenson, R.N. Zadoks, R. Biek, ...

Azimi T., M.J. Nasiri, A.S. Chirani, R. Pouriran and H. ...

Babu K.N., M.K. Rajesh, K. Samsudeen, D. Minoo, E.J. Suraby, ...

Baharsefat M., A. Amjadi, P. Ahourai, B. Yamini, F. Entessar ...

Biet F., I.A. Sevilla, T. Cochard, L.H. Lefrancois, J.M. Garrido, ...

Bryant J.M., V.C. Thibault, D.G. Smith, J. McLuckie, I. Heron, ...

Castellanos E., L. de Juan, L. Dominguez and A. Aranaz. ...

Filliol I., A.S. Motiwala, M. Cavatore, W. Qi, M.H. Hazbon, ...

Garvey M. 2018. Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis: A possible causative ...

Gerrard Z.E., B.M.C. Swift, G. Botsaris, R.S. Davidson, M.R. Hutchings, ...

Haghkhah M., A. Derakhshandeh, R. Jamshidi, A. Moghiseh, N. Karimaghaei, ...

Juste R.A., P. Vazquez, O. Ruiz-Larranaga, M. Iriondo, C. Manzano, ...

Keshavarz R., N. Mosavari, K. Tadayon and M. Haghkhah. 2018. ...

Larsson A. 2014. AliView: a fast and lightweight alignment viewer ...

Leão C., R.J. Goldstone, J. Bryant, J. McLuckie, J. Inácio, ...

Lekota K.E., A. Hassim, P. Rogers, E.H. Dekker, R. Last, ...

McIntyre K.M., C. Setzkorn, P.J. Hepworth, S. Morand, A.P. Morse ...

Pierce E.S. 2018. Could Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis cause Crohn ...

Sekhavati M., K. Tadayon, R. Ghaderi, R. Banihashemi, A.R. Jabbari, ...

Sevilla I., J.M. Garrido, M. Geijo and R.A. Juste. 2007. ...

Tadayon K., N. Mosavari, R. Keshavarz, A. Shahmoradi, R. Ghaderi, ...

Talatchian M. 1965. First report of Johne s disease in ...

Wynne J.W., T. Seemann, D.M. Bulach, S.A. Coutts, A.M. Talaat ...

Zarei Kordshouli F., A. Khodakaram Tafti and M. Haghkhah. 2016. ...

نمایش کامل مراجع