سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

Login
PapersConferencesJournals

استفاده از یک سیستم VNTR بومی شده متکی بر دو لوکوس در دسته بندی ژنتیکی جدایه های صحرایی بورخولدریا مالئی در ایران

Publish place: Veterinary Research & Biological Products، Vol: 31، Issue: 2
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 496

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Export:

Link to this Paper:
https://civilica.com/doc/886490

Document National Code:

JR_VTJ-31-2_006

Index date: 3 July 2019

استفاده از یک سیستم VNTR بومی شده متکی بر دو لوکوس در دسته بندی ژنتیکی جدایه های صحرایی بورخولدریا مالئی در ایران abstract

بورخولدریا مالئی باکتری مسبب مشمشه با میزبان های عمدتا تک سمی خود سازگای یافته است و قادر به ادامه حیات طولانی در خارج از بدن میزبان نیست. ایران بصورت سالانه اپیدمی های این بیماری را تجربه می نماید. در سال های اخیر ژنوتایپینگ مبتنی بر لوکوس های چندگانه متشکل از واحدهای تکرار شونده پشت سرهم به عنوان روش انتخابی برای مشمشه پذیرفته شده است. با هدف ارزیابی مقایسه ای قدرت تفریق دو لوکوس VNTR به نام های VNTR1217 و VNTR13 تکنیک VNTR-PCR بر روی 5 سویه بورخولدیا مالئی ایران اجرا گردید. توالی نوکلئوتیدهای محصولات PCR به منظور اطمینان از درستی اندازه و همچنین ساختار ژنتیکی تعیین گردید. ضمنا تعداد 29 سویه بورخولدریا مالئی نیزدر تحقیق وارد شدند. نتایج نشان دادند همه سویه ها در ژنوم خود لوکوس VNTR13 را که در تحقیق حاضر معرفی گردید حمل می نمایند در حالیکه وجود لوکوس VNTR1217 در ژنوم 4 سویه احراز نگردید. اندیکس Nei di درمورد لوکوس VNTR13 بالاتر از VNTR1217 (0.8 در مقایسه با 0.74) تعیین گردید. تعداد آلل های شناخته شده توسط لوکوس های VNTR13 و VNTR1217 در میان سویه های ایران بترتیب 2 و 3 مورد بود. بر اساس این یافته ها اگر بنا بر انتخاب مجموعه ای از لوکوس های VNTR مناسب برای معرفی یک سیستم جهانی MLVA در مورد بورخولدریا مالئی وجود داشته باشد لازم است همه لوکوس های فعلی بر روی کلکسیونی از سویه های بورخولدریا مالئی از تمام جهان مورد آزمایش قرار گیرد. انجام چنین تحقیق گسترده ای تنها در صورت همکاری میان آزمایشگاه های مرجع مورد تایید OIE امکان پذیر خواهد بود.

استفاده از یک سیستم VNTR بومی شده متکی بر دو لوکوس در دسته بندی ژنتیکی جدایه های صحرایی بورخولدریا مالئی در ایران Keywords:

استفاده از یک سیستم VNTR بومی شده متکی بر دو لوکوس در دسته بندی ژنتیکی جدایه های صحرایی بورخولدریا مالئی در ایران authors

شجاعت دشتی بور

گروه زیست شناسی دانشگاه پیام نور، واحد تهران شرق، تهران، ایران. بخش توبرکولین PPD، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

کیوان تدین

بخش واکسن های باکتریایی هوازی دامپزشکی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

نادر مصوری

بخش توبرکولین PPD، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

سید کاظم بیدوکی

گروه زیست شناسی دانشگاه پیام نور، واحد تهران- شرق، تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Carver T., S.R. Harris, T.D. Otto, M. Berriman, J. Parkhill ...
Chantratita N., M. Vesaratchavest, V. Wuthiekanun, R. Tiyawisutsri, T. Ulziitogtokh, ...
Currie B.J., A. Haslem, T. Pearson, H. Hornstra, B. Leadem, ...
Elschner M.C., H. Neubauer and L.D. Sprague. 2017. The Resurrection ...
Elschner M.C., P. Thomas and F. Melzer. 2016. Complete Genome ...
Godoy D., G. Randle, A.J. Simpson, D.M. Aanensen, T.L. Pitt, ...
Harvey S.P. and J.M. Minter. 2005. Ribotyping of Burkholderia mallei ...
Johnson S.L., K.A. Bishop-Lilly, J.T. Ladner, H.E. Daligault, K.W. Davenport, ...
Johnson S.L., K.A. Bishop-Lilly, J.T. Ladner, H.E. Daligault, K.W. Davenport, ...
Khaki P., N. Mosavari, N.S. Khajeh, M. Emam, M. Ahouran, ...
Larsson A. 2014. AliView: a fast and lightweight alignment viewer ...
Lin Y., Q. Wu, X. Liu, S. Dong, L. Wu, ...
Malik P., H. Singha, S.K. Goyal, S.K. Khurana, B.N. Tripathi, ...
Michelle Wong Su Y., O. Lisanti, F. Thibault, S. Toh ...
Najafpour R., N. Mosavari, K. Tadayon and E. Tajbakhsh. 2015. ...
Price E.P., H.M. Hornstra, D. Limmathurotsakul, T.L. Max, D.S. Sarovich, ...
Scholz H.C., T. Pearson, H. Hornstra, M. Projahn, R. Terzioglu, ...
Segonds C., M. Thouverez, A. Barthe, N. Bossuet-Greif, L. Tisseyre, ...
Tabrizi E., K. Tadayon, N. Mosavari, E. Tajbakhsh, R. Keshavarz, ...
Taghipour A., N.S.M. Khaje, M.S. Ghaazi, Z.S. Masoodi and H. ...
Tanpiboonsak S., A. Paemanee, S. Bunyarataphan and S. Tungpradabkul. 2004. ...
Titball R.W., M.N. Burtnick, G.J. Bancroft and P. Brett. 2017. ...
U Ren J M., H. Hornstra, T. Pearson, J.M. Schupp, ...
U Ren J.M., J.M. Schupp, T. Pearson, H. Hornstra, C.L. ...
Untergasser A., H. Nijveen, X. Rao, T. Bisseling, R. Geurts ...
Zheng X., L.X. Wang, H. Wu, H. Chen, X. Zhu, ...
نمایش کامل مراجع