آلودگی های آب باعث به خطر انداختن زندگی ارگانیسم ها و موجودات آبزی می گردد. برای کاهش میزانآلودگی آب روشهای تصفیه بیولوژیکی و شیمیایی مختلفی وجود دارد، اما استفاده از میکروارگانیسم هایموثر که ترکیبی از روش هوازی و بی هوازی است امروزه بسیار مورد توجه قرار گرفته است که اساس آناستفاده از میکروارگانیسم هایی است که به طور طبیعی باعث احیای رودخانه ها می گردند. میکروارگانیسم-های موثر EM یک کود بیولوژیکی است که از ترکیب میکروارگانیسم های مفید موجود در طبیعت بدستمی آید و به طورعمده از گونه هایی همچون باکتری های فتوسنتتیک، اسیدلاکتیک و مخمر تشکیل شدهاست. این روش شامل میکروب های طبیعی است که سبب کاهش مقدار مواد سمی بیولوژیکی پساب جهتغلبه بر بوی نامطبوع آن میشود. استفاده از EM باعث کاهش میزان EC, PH ، قلیاییت، TDS, TS, BOD و COD می گردد. از میکرو ارگانیسم های فعال می توان در فعالیت هایی از جمله کشاورزی، باغبانی،دامداری، محوطه سازی، کمپوست، زیست پالایی و تمیز کردن مخازن سپتیک استفاده کرد . فواید دیگراستفاده از
میکروارگانیسم های فعال توقف رشد جلبک ها، کاهش لجن، سرکوب پاتوژن ها و از بین بردنبوی بد
بو ناشی از سطح بالای آمونیاک، سولفید هیدروژن و متان است.