شناسایی miRNA های دخیل در مسیر گل دهی گیاه چغندرقند (.Beta vulgaris L)
Publish place: Journal of Sugar Beet، Vol: 34، Issue: 2
Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 425
This Paper With 17 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JRSB-34-2_002
تاریخ نمایه سازی: 22 مهر 1398
Abstract:
یکی از فرآیندهای کنترلی در بسیاری از گیاهان از جمله چغندرقند انتقال از مرحله رشد رویشی به زایشی میباشد که توسط شبکه پیچیدهای از پروتئینها تنظیم میشود. تاکنون چندین مسیر تنظیمی دخیل در مسیر گلدهی و بولتینگ و ژنهای موثر در آنها در گیاه مدل آرابیدوپسیس شناسایی شده است. یک مسیر موثر در انتقال از مرحله رویشی به زایشی مسیر وابسته به سن است که تحتتاثیر دو miRNA172 و miRNA156 می باشد. ژنهای کدکننده miRNA ها در بین گیاهان بسیار گسترده و حفاظتشده هستند. در این تحقیق، برای شناسایی توالی این دو ژن در ژنوم چغندرقند، توالی آنها از چندین گیاه جمعآوری و با توالیهای Refseq-genomic چغندرقند مورد همردیفی قرار گرفتند. نواحی با توالی مشترک شناسایی و اطلاعات آنها به طور دقیق مورد بررسی قرارگرفت. نتایج نشان داد که در ژنوم چغندرقند برای ژن کدکننده miR156 فقط 127 جفت باز از کروموزوم شماره 2 و ژن کدکننده miR172 فقط 110 جفت باز از کروموزوم شماره 9 دارای توالیهای کامل پیشساز miRNA بودند. جداسازی ژن کدکننده miR156 از ژنوم گیاه چغندرقند، با طراحی آغازگرهای اختصاصی از نواحی ابتدا و انتهای ژن انجام گرفت. ژن کدکننده miR156 توسط تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی MIRF و MIRR از روی DNA ژنومی چغندرقند تکثیر شد. همانگونه که انتظار میرفت قطعه DNA 127 جفت باز تکثیر شد و در نهایت از طریق توالییابی مشابهت 99 درصدی توالی تکثیر شده با توالی شناسایی شده ژن کدکننده miR156 به دست آمد و صحت توالی شناسایی شده به عنوان ژن کدکننده miR156 در چغندرقند تایید گشت. شناسایی و مطالعه این ژنهای موثر در فرآیند گلدهی راه را برای قابلیت بررسی عملکرد دقیق آنها در فرآیندهای گلدهی و بولتینگ چغندرقند خواهد گشود.
Keywords:
Authors
میشانه عسگری
دکتری بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا. همدان، ایران.
اصغر میرزائی اصل
دانشیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا. همدان، ایران.
محمدرضا عبدالهی
دانشیار گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا. همدان، ایران.
لیلا خدایی
استادیار گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور همدان. همدان، ایران.
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :