طراحی محاسباتی یک واکسن جدید مولتی-اپیتوپ کایمریک به منظور تقویت پاسخهای ایمنی علیه نایسریا مننژیتیدیس سروگروپ B

سابقه و هدف : نایسریا مننژیتیدیس سروگروپ B یکی از علل کلیدی مرگ ومیر ناشی از مننژیت مننگوکوکی و سپسیس در کشورهای در حال توسعه است. علیرغم دسترسی به واکسن برای سایر سروگروپها، واکسن موثری برای این عامل عفونی ایجاد نشده است. اخیرا مطالعاتبا تاکید بر روی واکسنهای مبتنی بر اپیتوپ برای جلوگیری از بیماری های عفونی متمرکز شده است.لذا این مطالعه با هدف ساخت یک واکسن مبتنی بر اپیتوپ علیه نایسریا مننژیتیدیس سروگروپ B با استفاده از آنتی ژنهای ، FHbp، NspA، TbpB، PilQ و NspAاین عامل عفونی انجام شد. مواد و روشها : اپیتوپ های CTL، HTL، MHCI و ,)1 آنتی ژنهای نامبرده شده به ترتیب به وسیله سرورهای CTLPRED، IEDB و IFNepitope پیشبینی شد. همچنین برای القای پاسخ ایمنی شدید توسط لنفوسیتهای T کمک کنننده 4CD + و تحویل داخل سلولی پروتئین مدل شده به ترتیب از PADRE وTAT استفاده شد.علاوه بر این، برای تقویت پاسخ ایمنی لوپهای 5و7 PorB (آگونیست (2TLR به عنوان ادجونت به ساختار اضافه گردید. در نهایت اپیتوپهای انتخاب شده، ادجونت، PADRE و TAT از طریق لینکرهای GPGPG،AAY وEAAAK به یکدیگر متصل شدند. یافته ها: با توجه به اپیتوپ های پیش بینی شده، واکسن مولتی-اپیتوپ با 617 اسید آمینه ساخته شد. خواص فیزیکی و شیمیایی، حلالیت، آنتی ژنیسیته، آلرژنسیته، ساختارهای دو بعدی و سه بعدی، استحکام و اختلالات پروتئینی درونی واکسن طراحی شده با استفاده از ابزارهای ایمونوانفورماتیکی مورد بررسی قرارگرفت. پروتئین محلول، آنتی ژن و غیر آلرژیک با وزن مولکولی 65.431 کیلو دالتون بدست آمد. تجزیه و تحلیل های بیشتر اعتبار پایداری پروتئین کایمریک را تایید کرد. سپس ، برای ارزیابی پایداری واکسن-2TLR مطالعات داکینگ و شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام شد. در نهایت، کلونینگ واکسن طراحی شده با استفاده از وکتور (+) b21pET-برای اطمینان از کارایی بیان و ترجمه آن توسط نرم افزار snapgene انجام شد.نتیجه گیری : تجزیه وتحلیل ایمونوانفورماتیکی نشان داد که واکسن مولتی-اپیتوپ طراحی شده می تواند به طور مناسب پاسخ های ایمنی هومورال و سلولی را تحریک کند و به طور بالقوه می تواند برای استفاده های پیشگیرانه یا درمانی مورد استفاده قرار گیرد.

Keywords:

نایسریا مننژیتیدیس سروگروپ B , ایمونوانفورماتیک , واکسن مولتی-اپیتوپ , ایمنی سلولی , ایمنی هومورال