بررسی کارآیی نشانگرهای مولکولی در ارزیابی تنوع ژنتیکی کلون های مختلف چای ایران

مجتبی کردرستمی; مهدی رحیمی; صنم صفائی چائی کار; علی سراجی

بررسی کارآیی نشانگرهای مولکولی در ارزیابی تنوع ژنتیکی کلون های مختلف چای ایران

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 11، Issue: 2

Publish Year: 1398

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 22 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/970868

Document National Code:

JR_JOAGK-11-2_005

Index date: 24 December 2019

بررسی کارآیی نشانگرهای مولکولی در ارزیابی تنوع ژنتیکی کلون های مختلف چای ایران abstract

هدف: تنوع ژنتیکی 20 کلون چای جمعآوری شده از سازمان تحقیقات چای کشور، با استفاده از 20 نشانگر ریزماهواره و 10 نشانگر RAPD مورد ارزیابی قرار گرفت. مواد و روش ها: مواد گیاهی در این آزمایش 20 کلون چای انتخابی در موسسه تحقیقات چای کشور بود. استخراج DNA از نمونههای برگ جوان کلون های چای با استفاده از روش CTAB با اندکی تغییرات انجام گرفت. نتایج: نتایج نشان داد که نشانگرهای ریزماهواره و RAPD به ترتیب تعداد 105 و 160 نوار چندشکل تولید کردند. از میان نشانگرهای ریزماهواره، آغازگر MSE0143 با 9 باند و آغازگر MSG0681 با 8 باند بیشترین و آغازگر MSG0610 با 2 باند، کمترین تعداد قطعات تکثیرشده را ایجاد کردند. نشانگرهای MSG0681، MSE0113، MSG0403 با دارا بودن بیشترین میزان تعداد آلل مشاهده شده، آلل موثر، شاخص تنوع ژنی نئی، شاخص شانون و میزان اطلاعات چند شکلی در این مطالعه به عنوان موثرترین نشانگرهای ریزماهواره جهت تجزیه تنوع ژنتیکی در کلون های مطالعه شده شناسایی شدند. از میان نشانگرهای RAPD، آغازگر OS-03 با تعداد 19 باند، بیشترین تعداد باند و آغازگر OR-12 با تعداد 13 باند کمترین تعداد باند را تولید کردند. نتیجه گیری: با مقایسه میانگین میزان اطلاعات چند شکل (PIC) دو سیستم نشانگری مشخص شد که نشانگرهای ریزماهواره نسبت به RAPD کارایی بیشتری دارند. به عنوان مثال، میانگین مقدار PIC برای نشانگرهای SSR 66/0 در سراسر کلون های چای اندازه گیری شد. با مقایسه شاخص های QND و EMI مشخص شد که نشانگرهای ریزماهواره نسبت به نشانگرهای RAPD برتر هستند. همچنین با مقایسه نتایج تجزیه خوشه ای دو نشانگر تعیین گردید که نشانگرهای ریزماهواره بهتر قادر بودند تا کلون ها را بر اساس منشا جغرافیایی شان طبقه بندی کنند.

بررسی کارآیی نشانگرهای مولکولی در ارزیابی تنوع ژنتیکی کلون های مختلف چای ایران Keywords:

چای , نشانگرهای ریزماهواره , کارآیی نشانگر , محتوای اطلاعات چندشکلی , RAPD

بررسی کارآیی نشانگرهای مولکولی در ارزیابی تنوع ژنتیکی کلون های مختلف چای ایران authors

مجتبی کردرستمی

دانش آموخته دکتری، باشگاه پژوهش گران جوان و نخبگان، واحد اراک، دانشگاه آزاد اسلامی، اراک، ایران.

مهدی رحیمی

گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان

صنم صفائی چائی کار

استادیار، پژوهشکده چای، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، لاهیجان، ایران

علی سراجی

استادیار، پژوهشکده چای، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، لاهیجان، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Ahuja P, Gulati A, Singh R et al. (2013) Science ...

Baraket G, Chatti K, Saddoud O et al. (2011) Comparative ...

Bhardwaj P, Sharma R, Kumar R et al. (2014) SSR ...

Boonerjee S, Islam MN, Hoque M et al. (2013) Genetic ...

Chen L, Yamaguchi S (2002) Genetic diversity and phylogeny of ...

Cregan P, Schaap T (2010) Application of DNA Markers for ...

Hartl DL, Clark AG, Clark AG (1997) Principles of population ...

Heidari S, Marashi H, Farsi M et al. (2009) Assessment ...

Kaundun SS, Zhyvoloup A, Park Y-G (2000) Evaluation of the ...

Kordrostami M, Rabiei B, Kumleh H (2016) Association analysis, genetic ...

Lai J-A, Yang W-C, Hsiao J-Y (2001) An assessment of ...

Lynch M, Walsh B (1998) Genetics and analysis of quantitative ...

Melchinger A (1999) Genetic diversity and heterosis. The genetics and ...

Naghavi MR, Qarayazi B, Hosseini Salekdeh Q (2009) Molecular markers. ...

Nei M (1973) Analysis of gene diversity in subdivided populations. ...

Nili A, Rabiei B, Allahgholipour M et al. (2017) Assessing ...

Poehlman JM (2013) Breeding field crops. Springer Science & Business ...

Powell W, Morgante M, Andre C et al. (1996) The ...

Quartz (2016) Annual per capita tea consumption worldwide as of ...

Rezaee E, Mirlohi M, Hassanzadeh A et al. (2016) Factors ...

Roy S, Chakraborty B (2009) Genetic diversity and relationships among ...

Shannon CE (2001) A mathematical theory of communication. ACM SIGMOBILE ...

Sivapalan P, Kulasegaram S, Kathiravetpillai A (1986) Handbook on tea. ...

Tan L-Q, Peng M, Xu L-Y et al. (2015) Fingerprinting ...

Taniguchi I (2014) Development of Genomic Resources and Core Collections ...

Varshney RK, Chabane K, Hendre PS et al. (2007) Comparative ...

Wachira FN, Kamunya S, Karori S et al. (2013) The ...

Wang RJ, Gao XF, Kong XR et al. (2016) An ...

Weising K, Nybon H, Wolff K et al. (2005) DNA ...

Xu Y (2010) Molecular Plant Breeding., CABI Publishing. ...

Yao M-Z, Ma C-L, Qiao T-T et al. (2012) Diversity ...

Zhang DX, Hewitt GM (2003) Nuclear DNA analyses in genetic ...

Zhang Y, Zhang X, Chen X et al. (2018) Genetic ...

نمایش کامل مراجع