استفاده از ظرفیت های روش های نوین توالی یابی ( NGS ) در مطالعه ژنوم عناب ( Ziziphus jujuba )

ایران دارای رتبه سوم جهانی از نظر سطح زیر کشت و تولید عناب است. سطح زیر کشت محصول عناب در ایران حدود 3000 هکتار می باشد که از این سطح بیش از 95 ٪ آن یعنی حدود 2850 هکتار آن در خراسان جنوبی واقع شده و 4200 تن محصول عناب از آن تولید می گردد. بررسی سوابق تاریخی خراسان جنوبی نشان می دهد. در سال 2015 محققین چینی توانستند ژنوم عناب را با استفاده از روش Illumina HiSeq توالی یابیکنند و هم اکنون امکان دسترسی به اطلاعات ژنوم عناب از طریق پایگاه داده NCBI تحت شماره شناسایی GCF_000826775.1 وجود دارد. با توجه به اهمیت عناب در ایران بویژه استان خراسان جنوبی لزوم استفاده از این ظرفیت تحقیقاتی به منظور شناسایی ویژگی های منحصر به فرد ارقام عناب ایرانی احساس می گردد. در این پژوهش مروری، ضمن بررسی ژنوم عناب از لحاظ سیتوژنتیکی، روش های موجود جهت بررسی ژنوم و ترانسکریپتوم ارقام عناب ایرانی و شماری از ملاحظات کلیدی ارائه می گردد.

Keywords:

ترانسکریپتوم , عناب , ژنومیکس , توالی یابی