شناسایی گونه های تریکودرما با استفاده از توالی یابی جزیی ژن های nrRNA و tef1α همراه با معرفی Trichoderma capillare برای میکوفلور ایران

گونه های تریکودرما به فراوانی در خاک های کشاورزی یافت میشوند و اغلب آنها بعنوان عامل بیوکنترلی علیه بیمارگرهای گیاهی عمل می کنند. آنها همچنین بعنوان تولیدکننده های صنعتی آنزیم ها شناخته می شوند. با توجه به اهمیت این قارچ، شناسایی صحیح آن ها در سطح گونه ضروری می باشد. شناسایی گونه ها مبتنی بر خصوصیات ریخت شناسی با توجه به هموپلاسی زیاد در صفات ظاهری مناسب نمی باشد. در این تحقیق، 40 جدایه تریکودرما از استان های اصفهان، اراک و همدان با استفاده از توالی یابی جزیی ژن های nrRNA و tef1α شناسایی شد. جدایه ها در محیط PDB کشت شد و توده میسیلیومی با استفاده از کاغذ صافی جمع آوری شد. میسیلیوم ها در لیوفیلیزر خشک-انجمادی و سپس از آن استخراج DNA شد. واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت تکثیر حدود 550 و 900 جفت باز بترتیب از نواحی ITS و tef1α با استفاده از آغازگرهای عمومی و تخصصی انجام شد. قطعات توالی های نوکلیوتیدی ITS و tef1α جدایه ها در هفت گروه گونه ای شاملT. ،T. pleuroticola ،T. capillare ،Trichoderma harzianum T. brevicompactum ،T. koningiopsis ،asperellum و T. virens توزیع شدند. درخت فیلوژنتیکی این جدایه ها با استرین های مرجع تیپ بر اساس توالی tef1α ترسیم شد که در آن خوشه بندی فیلوژنتیکی تولید شده اصالت گونه ای جدایه های مورد بررسی را تایید کرد. این اولین گزارش گونه T. capillare برای میکوفلور ایران است

شناسایی گونه های تریکودرما با استفاده از توالی یابی جزیی ژن های nrRNA و tef1α همراه با معرفی Trichoderma capillare برای میکوفلور ایران Keywords:

و DNA بارکدینگ , خوشه بندی فیلوژنتیک , ریخت شناسی