ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
Login |Register |Help |عضویت کتابخانه ها
Paper
Title

مطالعه بیان ژن افتراقی زنبور عسل ملکه، نر و کارگر با استفاده از داده های RNA-seq

Year: 1398
COI: JR_IJAS-50-2_002
Language: PersianView: 176
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download

Buy and Download

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این Paper را که دارای 11 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

Authors

محمدرضا عطاری - دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
حسین مرادی شهربابک - استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
غلامعلی نهضتی - استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
محمد حسین بنابازی - استادیار، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، کرج، ایران

Abstract:

این پژوهش با هدف مطالعه پروفایل بیان ژن و تعیین ژن های شاخص در تمایز و تکامل ملکه، نر و کارگر با مقایسه تفریقی آن ها در سن 5 لاروی یا همان سن تمایز انجام شد. لذا ترانسکریپتوم (توالی کل mRNA) 15 نمونه از زنبور عسل نژاد ایتالیایی (A. m. ligustica) شامل 5 زنبور نر، 5 کارگر و 5 ملکه از طریق همردیفی و مکان­یابی خوانش­های RNA-Seq بر روی ژنوم مرجع زنبور عسل نسخه Amel_4.5 مرتب شد. سپس آنالیز بیان افتراقی ژن صورت گرفت و در نهایت 15962 ژن و 31297 ایزوفرم بر روی ترانسکریپتوم این نمونه ها مشخص شد و نهایتا 465 ژن با بیان متفاوت بین تیمارهای نر و ملکه، 495 ژن بین تیمارهای کارگر و ملکه و 764 ژن بین تیمارهای نر و کارگر بود (000005/0p<)، (0001/0p<) و بیشترین تفاوت بیان ژنی بین تیمارهای کارگر و نر، ژن های GB45614 و GB42053 با لگاریتم 2 fold change به ترتیب با مقادیر 10- و 5/11 به دست آمدند و در مقایسه تیمارهای نر و ملکه ژن های GB45614 و GB48020 به ترتیب با مقادیر 7/11 و 8/11 و در مقایسه تیمارهای ملکه و کارگر ژن های GB43508 و GB42053 به ترتیب با مقادیر 6/6 و 9- با بیشترین تفاوت بیان ژنی مشاهده شدند. آنالیز ماهیت ژن (GO) و مسیرهایی که در آن­ها درگیر هستند نشان داد، که بررسی دقیقی و جامعی بر روی تعداد زیادی از این ژن ها انجام نشده است، ولی تعداد زیادی از این ژن های شاخص در مقایسه تیمارهای: ملکه و نر مرتبط با اجزای ساختاری و جدایی ناپذیر غشا، پردازش متابولیکی کیتین، بازدارنده های تریپسین، فعالیت گیرنده گاسترین، باندشونده با هورمون جوانی، پاسخ های دفاعی نسبت به باکتری ها، پروتئین های کوتیکول شفیره هستند درصورتی که در مقایسه ژن های شاخص متمایز در تیمارهای ملکه و کارگر مرتبط با مسیرهای متابولیکی، متابولیسم داروها و سایر آنزیم­ها، متابولیسم لیپیدها، باندشونده با نوکلئیک اسید، انتقال دهنده کلسترول داخل سلولی، پردازش های متابولیکی کیتین، بیوسنتز یوبیکینون و سایر ترپنوئید کینون ها و ژن های متمایز در مقایسه کارگر و نر مرتبط ا اجزای ساختاری و جدایی ناپذیری از غشای متابولیسم و انتقال آمینو اسیدها، باند شونده با یون کلسیم، باندشونده با فلز یون، انتقال دهنده کلسترول کیتین درون سلول، متابولیسم بودند.

Keywords:

بیان افتراقی ژن, ترانسکریپتوم, زنبورعسل, ماهیت ژن, RNA-Seq

Paper COI Code

This Paper COI Code is JR_IJAS-50-2_002. Also You can use the following address to link to this article. This link is permanent and is used as an article registration confirmation in the Civilica reference:

https://civilica.com/doc/1015685/

How to Cite to This Paper:

If you want to refer to this Paper in your research work, you can simply use the following phrase in the resources section:
عطاری، محمدرضا و مرادی شهربابک، حسین و نهضتی، غلامعلی و بنابازی، محمد حسین،1398،مطالعه بیان ژن افتراقی زنبور عسل ملکه، نر و کارگر با استفاده از داده های RNA-seq،،،،،https://civilica.com/doc/1015685

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

  • Andrews, S. (2010). FastQC: a quality control tool for high ...
  • Banabazi, M. H., Naserkheil, M. &amp; Miraei-Ashtiani, S. R. (2012a). ...
  • Banabazi, M. H., Naserkheil, M. &amp; Miraei-Ashtiani, S. R. (2012b). ...
  • Barchuk, A. R., Cristino, A. S., Kucharski, R., Costa, L. ...
  • Bolger, A. M., Lohse, M. &amp; Usadel, B. (2014). Trimmomatic: ...
  • Park, D., Jung, J. W., Choi, B. S., Jayakodi, M., ...
  • Ekblom, R. &amp; Galindo, J. (2010). Applications of next generation ...
  • Gan, Q., Chepelev, I., Wei, G., Tarayrah, L., Cui, K., ...
  • Haas, B. J. &amp; Zody, M. C. (2010). Advancing RNA-seq ...
  • He, X.-J., Jiang, W.-J., Zhou, M., Barron, A. B. &amp; ...
  • Langmead, B. &amp; Salzberg, S. (2012). Fast gapped-read alignment with ...
  • Li, H. &amp; Durbin, R. (2009). Fast and accurate short ...
  • Goff, L. A., Trapnell, C. &amp; Kelley, D. (2012). CummeRbund: ...
  • Marguerat, S. &amp; Bähler, J. (2010). RNA-seq: from technology to ...
  • Mortazavi, A., Williams, B., McCue, K., Schaeffer, L. &amp; Wold, ...
  • Ashby, R., Forêt, S., Searle, I. &amp; Maleszka, R. (2016). ...
  • Sultan, M., Schulz, M. H., Richard, H., Magen, A., Klingenhoff, ...
  • Tahmasebi, Gh. &amp; Porgharaei, H. (2000). Investigating the role of ...
  • Wilhelm, B. T. &amp; Landry, J. R. (2009). RNA-Seq-quantitative measurement ...
  • Wu, X. B., Wang, Z. L., Gan, H. Y., Li, ...
  • Research Info Management

    Certificate | Report | من نویسنده این مقاله هستم

    اطلاعات استنادی این Paper را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    Reviews

    5.00
    1 تعداد پژوهشگران نظر دهنده
    5 1
    4 0
    3 0
    2 0
    1 0

    Scientometrics

    The specifications of the publisher center of this Paper are as follows:
    Type of center: دانشگاه دولتی
    Paper count: 63,948
    In the scientometrics section of CIVILICA, you can see the scientific ranking of the Iranian academic and research centers based on the statistics of indexed articles.

    Share this page

    More information about COI

    COI stands for "CIVILICA Object Identifier". COI is the unique code assigned to articles of Iranian conferences and journals when indexing on the CIVILICA citation database.

    The COI is the national code of documents indexed in CIVILICA and is a unique and permanent code. it can always be cited and tracked and assumed as registration confirmation ID.

    Support