پویش ژنگانی نشانه های انتخاب مرتبط با بیماری ورم پستان در گاو هلشتاین آلمانی

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 382

This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-48-3_014

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

Abstract:

اهلی­سازی و انتخاب به شدت در ویژگی های ظاهری و رفتاری حیوان های اهلی امروزی تغییر ایجاد کرده است. در این مسیر انتخاب­های انجام شده توسط انسان نشانه­های قابل شناسایی را در ژنگان (ژنوم) گاوهای امروزی به جا گذاشته که آشکار­سازی این نشانه­ها می­تواند به اصلاح و بهبود ژنتیکی صفات مهم اقتصادی در این دام ها کمک کند. امروزه بیماری ورم پستان یکی از مهم ترین چالش­های اقتصادی در صنعت گاو شیری است که به طور عمده به دلیل انتخاب گسترده در دهه­های اخیر برای افزایش تولید شیر به وجود آمده است. در این تحقیق با هدف شناسایی مناطق ژنگانی مرتبط با ورم پستان، از اطلاعات طرح ملی گاو شیری هلشتاین آلمان استفاده شد. نمونه­ها با استفاده از آرایه­های Illumina Bovine 50K SNP تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. 133 راس دام بیمار و 133 راس دام سالم بر پایه اطلاعات ثبت شده در رابطه با ابتلا به ورم پستان در نخستین دوره شیردهی برای جستجوی نشانه­های انتخاب با استفاده از آماره تمایز جمعیتی تتا انتخاب شدند. با در نظر گرفتن صدک 9/99 کل ارزش­های تتا، ده ناحیه ژنگانی روی کروموزوم­های 1 (2 ناحیه)، 3، 5، 6، 14 (2 ناحیه)، 21 (2 ناحیه) و 28 شناسایی شد. بررسی­های بیشتر داده های زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد، ژن­های موجود در این مناطق با سامانه ایمنی و بیماری­های خود ایمنی، شبکه عصبی، انواع سرطان از جمله سرطان پستان و تولید شیر مرتبط هستند. در مجموع، نتایج این تحقیق می­تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی درزمینه شناسایی مناطق ژنگانی و درنتیجه ژن­های مرتبط با ورم پستان در گاو شیری فراهم آورد.

Authors

بیتا عباسی مشایی

دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

قدرت رحیمی میانجی

استاد، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

اردشیر نجاتی جوارمی

دانشیار، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران

محمد حسین مرادی

استادیار، گروه علوم دامی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Akey, J. M. (2009). Constructing genomic maps of positive selection ...
  • Akey, J. M., Zhang, G., Zhang, K., Jin, L. & ...
  • Bagheri, M., Mirai-Ashtiani, R., Moradi-Shahrbabak, M., Nejati-Javaremi, A., Pakdel, A., ...
  • Barendse, W., Harrison, B. E., Bunch, R. J., Thomas, M. ...
  • Biswas, S. & Akey, J. M. (2006). Genomic insights into ...
  • Crowder, R. J., Phommaly, Ch., Tao, Y., Hoog, J., Luo, ...
  • De Simoni Gouveia, J. J., Da Silva, M. V. G. ...
  • Gholami, M. (2014). Selection signature detection in a diverse set ...
  • Gu, J., Orr, N., Park, S. D., Katz, L. M., ...
  • Hays, B. J., Chamberlain, A. J., Maceachern, S., Savin, K., ...
  • Kaupe, B., Brandt, H., Prinzenberg, E. M. & Erhardt, G. ...
  • Kimura, M. (1989). The neutral theory of molecular evolution and ...
  • MacEachern, S., Hayes, B., McEwan, J. & Goddard, M. (2009). ...
  • Mancini, G., Gargani, M., Chillemi, G., Nicolazzi, E. L., Marsan, ...
  • Manzari, Z., Mehrabani-Yeganeh, H., Nejati-Javaremi, A. & Moradi, M. H. ...
  • Manzari, Z., Mehrabani-Yeganeh, H., Nejati-Javaremi, A., Moradi, M. H. & ...
  • Marques, E. F. (2009). Application of genomics-based tools leading to ...
  • Moradi, M. H., Nejati-Javaremi, A., Moradi-Shahrbabak, M., Dodds, K. G. ...
  • Moradi, M. H., Nejati-Javaremi, A., Moradi-Shahrbabak, M., Dodds, K. G. ...
  • Moradi, M. H., Phua, S. H., Hedayat, N., Khodaei-Motlagh, M. ...
  • Ogorevc, J., Kunej, T., Razpet, A. & Dovc, P. (2009). ...
  • Pasandideh, M., Kharrati Koopaei, H., Mohammad Abadi, M. R. & ...
  • Planells-Ferrer, L., Urresti, J., Coccia, E., Galenkamp, K. M., Calleja-Yagüe, ...
  • Qanbari, S., Pimentel, E. C. G., Tetens, J., Thaller, G., ...
  • Qanbari, S., Gianola, D., Hayes, B., Schenkel, F., Miller, S., ...
  • Randhawa, I. A. S., Khatkar, M. S., Thomson, P. C. ...
  • Sotgia, F., Whitaker-Menezes, D., Martinez-Outschoorn, U. E., Salem, A. F., ...
  • Stella, A., Ajmone-Marsan, P., Lazzari, B. & Boettcher, P. (2010). ...
  • Swiderek, W. P., Charon, A. W. & Gruszczynska, J. (2006). ...
  • Teo, Y. Y., Fry, A. E., Clark, T. G., Tai, ...
  • Tilli, T. M., da Silva Castro, C., Tuszynski, J. A. ...
  • Urbinati, I., Stafuzza, N. B., Oliveira, M. T., Chud, T. ...
  • Weir, B. S. & Clark Cockerham, C. (1984). Estimating F-statistics ...
  • Wright, S. (1951). The genetical structure of populations. Annals of ...
  • Wright, S. (1965). The interpretation of population structure by F-statistics ...
  • Zhao, F., McParland, S., Kearney, F., Du, L. & Berry, ...
  • نمایش کامل مراجع