ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

تعیین جایگاه های تحت انتخاب مثبت در نژادهای گوسفند ایرانی بلوچی و زل

Publish place: IRANIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE، Vol: 47، Issue: 3
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 369

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:
https://civilica.com/doc/1015829

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-47-3_007

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

Abstract:

نشانه­های انتخاب در کل ژنگان (ژنوم)، ما را در درک سازوکار­های انتخاب و شناسایی مناطقی از ژنگان که در طی سالیان متمادی به صورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شده­اند، راهنمایی می­کنند. هدف این تحقیق شناسایی نقاطی از ژنگان در گوسفندان زل و بلوچی بود که در طی سال­های مختلف به صورت مصنوعی یا طبیعی انتخاب شده­اند. 143 راس گوسفند بلوچی (96 راس) و زل (47 راس)، با استفاده از آرایه­های ژنگانیIllumina ovine SNP50K BeadChip  تعیین ژنوتیپ شدند. برای جستجوی نشانه­های انتخاب از آزمون نااریب FST ویر و کوکرهام (تتا) در بسته نرم افزاری R استفاده شد. نتایج 17 منطقه ژنگانی روی کروموزوم­های 3، 4، 5، 7، 10، 11، 12، 13، 15، 18 و X را شناسایی کرد. تجزیه وتحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنگانی با ژن­های موثر بر صفات گسترش نظام استخوان بندی (اسکلتی) و دم، ایمنی و یاخته شناختی (سیتولوژی) یاخته ای، سوخت و ساز (متابولیسم) قند و انرژی و تولید­مثلی مانند ژن­های RPS6KA3، HOXB9، ESPL1، AAAS، FNDC3A همپوشانی دارند. نتایج این تحقیق و جایگاه­های ژنگانی شناسایی شده می­تواند نقش مهمی در رابطه با بررسی تاثیر انتخاب در تمایز جمعیتی دو نژاد دنبه دار بلوچی و بدون دنبه زل و در پی آن شناسایی مناطق ژنگانی مرتبط با صفات متمایزکننده این دو نژاد داشته باشد.

Keywords:

Authors

زینب منظری

دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

حسن مهربانی یگانه

دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

اردشیر نجاتی جوارمی

دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

محمد حسین مرادی

استادیار، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Akey, J. M., Zhang, G., Zhang, K., Jin, L. & ...
  • Amaral, A. J., Ferretti, L., Megens, H. J., Crooijmans, R. ...
  • Aquadro, C. F., Bauer Dumont, V. & Reed, F. A. ...
  • Barendse, W., Harrison, B. E., Bunch, R. J., Thomas, M. ...
  • Barreiro, L. B., Laval, G., Quach, H., Patin, E. & ...
  • Bonhomme, M., Chevalet, C., Servin, B., Boitard, S., Abdallah, J., ...
  • Cavanagh, C. R., Attard, G., Palmer, D., Thomson, P. C., ...
  • Chen, F. & Capecchi, M. R. (1999). Paralogous mouse Hox ...
  • Chessa, B., Pereira, F., Arnaud, F., Amorim, A., Goyache, F., ...
  • Economides, K. D., Zeltser, L. & Capecchi, M. R. (2003). ...
  • Ensembl BioMart: Ensembl online genome data base BioMart Tool. http:// ...
  • Fariello, M. I., Servin, B., Tosser-Klopp, G., Rupp, R., Moreno, ...
  • Fredriksson, R., Nordstrom, K. J., Stephansson, O., Hagglund, M. G. ...
  • Gely-Pernot, A., Raverdeau, M., Celebi, C., Dennefeld, C., Feret, B., ...
  • GeneCards. http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl gene=STAT ...
  • Gholizadeh, M., Rahimi-Mianji, G., Nejati-Javaremi, A., De Koning, D. J. & ...
  • Hancock, A. M., Brachi, B., Faure, N., Horton, M. W., ...
  • Helms, C. (1990). Salting out Procedure for Human DNA extraction. ...
  • Kijas, J. W., Lenstra, J. A., Hayes, B., Boitard, S., ...
  • Khaldari, M., Kashan, N.E.J., Afzalzadeh, A. & Salehi, A. (2007). ...
  • Khaldari, M. (2014). Sheep and goat husbandry (5th Ed.). Jahade-daneshgahi ...
  • Lim, C. H., Jeong, W., Lim, W., Kim, K., Song, ...
  • Lopez, M. E., Naira, R. & Yanez, J. M. (2015). ...
  • Lv, F. H., Agha, S., Kantanen, J., Colli, L., Stucki, ...
  • Marai, I. F. M., Daader, A. H. & Bahgat, L. ...
  • MacEachern, S., Hayes, B., McEwan, J. & Goddard, M. (2009). ...
  • Morgan, C. C., Loughran, N. B., Walsh, T. A., Harrison, ...
  • Moradi, M. H., Nejati-Javaremi, A., Moradi-Shahrbabak, M., Dodds, K.G. & ...
  • Mottaghinia, Gh., Farhangfar, H. & Jafari, M. (2012). A study ...
  • Nielsen, R. (2005). Molecular signatures of natural selection. Annu. Rev. ...
  • Purcell, S., Neale, B., Todd-Brown, K., Thomas, L., Ferreira, M. ...
  • Ramey, H., Decker, J., McKay, S., Rolf, M., Schnabel, R. ...
  • Randhawa, I. A. S., Khatkar, M. S., Thomson, P. C. ...
  • Saadat-Noori, M. & Siah-Mansoor, S. (1987). Sheep husbandry and management. ...
  • Shrestha, B., Ansari, K. I., Bhan, A., Kasiri, S., Hussain, ...
  • Szklarczyk, D., Franceschini, A., Wyder, S., Forslund, K., Heller, D. ...
  • Teo, Y. Y., Fry, A. E., Clark, T. G., Tai, ...
  • The R Project for Statistical Computing: Free software environment for ...
  • Unal, N., Akcapinar, H., Aytac, M. & Atasoy, F. (2006).  ...
  • UniProtKB Gene. http://www.uniprot.org/help/gene_name. ...
  • Van den Akker, E., Fromental-Ramain, C., de Graaff, W., Le ...
  • Vaysse, A., Ratnakumar, A., Derrien, T., Axelsson, E., Pielberg, G. ...
  • Wang, H., Zhang, L., Cao, J., Wu, M., Ma, X., ...
  • Weedon, M. N., Lango, H., Lindgren, C. M., Wallace, C., ...
  • Wei, C. H., Wang, H. H., Liu, G., Wu, M. ...
  • Weir, B. S. & Cockerham, C. C. (1984). Estimating F-Statistics ...
  • Zeder, M. A. (1999). Animal domestication in the Zagros: a ...
  • Zheng, Y. H., Rengaraj, D., Choi, J. W., Park, K. ...
  • Zhu, C., Fan, H., Yuan, Z., Hu, S., Zhang, L., ...
    • نمایش کامل مراجع