ارزیابی الگوهای بیان ژن مشتق از ریزآرایه در مدل‫های موشی تراژن بیماری آلزایمر (تائو و آمیلوئید بتا) با استفاده از ابزارهای زیست داده ورزی‬‬‬‬‬‬‬‬‬‬‬‬

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 384

This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCT-10-1_001

تاریخ نمایه سازی: 19 خرداد 1399

Abstract:

هدف: در این پژوهش تغییرات بیان ژن و تاثیر آن بر شبکه­های پروتئینی، عوامل رونویسی، مسیرهای سلولی و RNAهای کوچک در مدل های موشی تراژن بیماری آلزایمر (آمیلوئید بتا و تائو) بررسی شد.مواد و روش ها: نتایج داده­های ریز آرایه ژن های بافت مغز در پایگاه داده GEO تجزیه و تحلیل، پیش بینی شبکه ها به کمک پایگاه داده String انجام و توسط نرم افزار Cytoscape آنالیز شد. پیش­بینی فاکتورهای رونویسی و مسیرهای سلولی ژن­ها در سرویس تحت وب Enrichr انجام گرفت. همچنین از درواره ToppGene برای شناسایی نقش RNAهای کوچک دخیل در این مدل­ها استفاده شد.نتایج: تجزیه و تحلیل شبکه­ های پروتئینی نشان داد ژن CTSS (کد کننده پروتئین کاتپسین اس)  که یک سیستئین پروتئاز لیزوزومی است در هر دو مدل ژن­ کلیدی و رابط شبکه ای می باشد. ژن های IRF8 (کد کننده پروتئین عامل 8 تنظیم کننده اینترفرون) و NFE2L2 (کد کننده پروتئین عامل 2 مرتبط با عامل هسته ای اریتروئیدی 2) که به ترتیب ژن­های دخیل در سیستم ایمنی و استرس اکسیداتیو هستند، به عنوان عوامل رونویسی تاثیرگذار تعیین شدند. به علاوه مشخص شد RNA کوچک let-7 (دخیل در سیستم ایمنی) می تواند به عنوان تنظیم کننده مهم بیان ژن ها در مسیرهای ژنی هر دو مدل بیماری عمل نماید.نتیجه‫گیری: سیستم ایمنی نقش بسیار مهمی در روند بیماری آلزایمر در هر دو مدل داشته و احتمالا کاهش فعالیت ژن های این سیستم (IRF8 و let-7) به همراه افزایش ژن های دخیل در کاهش استرس اکسیداتیو (CTSS و NFE2L2) در هر دو مدل یک هدف درمانی مناسب خواهد بود.واژگان کلیدی:

Keywords:

ریزآرایه#زیست داده ورزی#آلزایمر#تائو# آمیلوئید بتا

Authors

جواد امینی

دانشگاه زابل، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی، سیستان و بلوچستان، زابل، ایران

ناصر سنچولی

دانشگاه زابل، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی، سیستان و بلوچستان، زابل، ایران

نیما سندگل

دانشگاه زابل، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی، سیستان و بلوچستان، زابل، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • De Almeida AJPO, Ribeiro TP, de Medeiros IA. Aging: Molecular ...
  • World Alzheimer Report 2009. Alzheimer Disease International, 2009. 1.Kamdar BB, ...
  • Sharma GN, Dave R, Sanadya J, Sharma P, et al. ...
  • Perou CM, Borresen-Dale AL. Systems biology and genomics of breast ...
  • Antoniou AC, Easton DF. Models of genetic susceptibility to breast ...
  • Oncogene. 2006; 25(43): 5898-5905. ...
  • Vacchelli E, Aranda F, Bloy N, Buqu A, et al. ...
  • Singh JK, Simões BM, Howell SJ, Farnie G, et al. ...
  • Chia CY, Kumari U, Casey P. Breast cancer cell invasion ...
  • Snoussi K, Mahfoudh W, Bouaouina N, Fekih M , et ...
  • Lin1 Y. Identification of interleukin-8 as estrogen receptor-regulated factor involved ...
  • Huang Q, Wang C, Qiu LJ, Shao F, et al. ...
  • Taheri M, Hashemi M, Eskandari-Nasab E, Fazaeli A, et al. ...
  • Zhang J, Han X, Sun Sh. IL-8 -251A/T and +781C/T ...
  • He Y, SunSh, Liu Y,Tian K. Association of IL-8 genetic ...
  • Xiuyu C, Weihan H, BeiZh, Ni D, et al. Genotyping ...
  • Chen Y, Yang Y, Liu S, Zhu S, et al. ...
  • Wang Z, Gao ZM, Huang HB, Sun LS, et al. ...
  • Jessica C, Alwadris TT, Prasetyo SR, Puspitawati R, et al. ...
  • Matheson MC, Ellis JA, Raven J, Walters EH, et al. ...
  • Richie RC, Swanson JO. Breast Cancer: A Review of the ...
  • Harirchi I, Karbakhsh M, Kashefi A, Momtahen A J. Breast ...
  • Mousavi SM, Montazeri A, Mohagheghi MA, Jarrahi AM, et al. ...
  • De Andres PJ, Illera JC, Caceres S, Diez L, et ...
  • Vogel CF, Li W, Wu D, Miller JK, et al. ...
  • Agha-Alinejad H, Haftchenari SH, MatinHomaei H. Effect of a Period ...
  • Strieter RM, Kunkel SL, Elner VM, Martonyi CL, et al. ...
  • Wu S, Lu S, Tao H, Zhang L, et al ...
  • Snoussi K, Mahfoudh W, Bouaouina N, Ahmed SB, et al.  ...
  • Huang J, Li X, Hilf R, Bambara RA, et al. ...
  • Vairaktaris E, Serefoglou Z, Yapijakis C. High gene expression of ...
  • نمایش کامل مراجع