بررسی الگوی بیان نسبی ژن های کاندیدای تحمل به شوری در مرحله گیاهچه ای برنج با استفاده از پی سی آر در زمان واقعی

لیلا نیری پسند; قاسمعلی گروسی; اسدالله احمدی خواه

بررسی الگوی بیان نسبی ژن های کاندیدای تحمل به شوری در مرحله گیاهچه ای برنج با استفاده از پی سی آر در زمان واقعی

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 12، Issue: 2

Publish Year: 1399

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 28 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

کشاورزی > برنج

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1046714

Document National Code:

JR_JOAGK-12-2_007

Index date: 16 September 2020

بررسی الگوی بیان نسبی ژن های کاندیدای تحمل به شوری در مرحله گیاهچه ای برنج با استفاده از پی سی آر در زمان واقعی abstract

هدف: با توجه به این که برنج منبع تغذیه بیش از نیمی از مردم جهان است. همچنین رشد و عملکرد این گیاه به شدت تحت تاثیر تنش شوری قرار می گیرد، تحقیق برای توسعه واریته های متحمل به شوری امری ضروری است. لذا در این پژوهش، الگوی بیانی هفت ژن دخیل در تحمل به شوری با روش پی سی آر در زمان واقعی در ارقام برنج حساس (#6) ARC6578 و (#178) Shoemed و متحمل Bombilla (#48) مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها: نمونه RNA از گیاهچه های 20 روزه برنج تحت تیمار NaCl (100 میلی مولار) در سه زمان 24، 48 و 72 ساعت پس از اعمال تنش شوری استخراج شد. بررسی بیان ژن بر روی هفت ژن کاندیدا (شامل ژنهای SOD, Cat1, 14-3-3 like protein GF14، Proxidase BP1 precursor، Zinc ion binding protein Plasma membrane H+-ATPase, و OsSIPK) با روش پی سی آر در زمان واقعی انجام شد. از ژن اکتین به عنوان ژن مرجع استفاده شد. نتایج: بیان ژن OsSIPK در رقم متحمل، 24 و 48 ساعت بعد از تنش افزایش و 72 ساعت بعد از تنش شوری کاهش یافت در حالی که بیان ژن Zinc ion binding protein در تمام ارقام و در همه ساعات پس از تنش کاهشی بود. بیان ژن PM H+-ATPase در ساعات اولیه پس از تنش در هر دو رقم حساس و متحمل افزایش یافت ولی با گذشت 72 ساعت از تنش بیان این ژن در رقم حساس کاهش و در رقم متحمل افزایش یافت. بیان ژن 14-3-3 like protein GF14-6 48 ساعت پس از تنش در هر دو رقم حساس و متحمل به شدت افزایش یافت ولی با گذشت 72 ساعت از تنش بیان این ژن در رقم حساس کاهش و در رقم متحمل افزایش یافت. بیان ژن Similar to Peroxidase BP1 precursor 72 ساعت پس از تنش در رقم متحمل حدود 40 برابر افزایش یافت. بیان ژن کاتالاز 72 ساعت پس از تنش فقط در رقم متحمل افزایش معنی دار نشان داد. بیان ژن SOD از الگوی زمانی خاصی تبعیت نکرد هرچند بیان آن 72 ساعت پس از تنش در رقم متحمل بیشتر از ارقام حساس بود. نتیجه گیری: برخی ژن های مورد مطالعه در این تحقیق با حذف گونه های فعال اکسیژن (ROS) در پاسخ عمومی گیاه به تنش شوری نقش دارند (مانند ژن های SOD و CatA). از طرفی بین تحمل به شوری و میزان بیان برخی دیگر از ژن های مورد مطالعه می توان نوعی ارتباط وابسته به رقم-زمان را تشخیص داد (مانند ژن های OsSIPK، PM H+-ATPase، 14-3-3 like protein GF14-6 و Peroxidase BP1).

بررسی الگوی بیان نسبی ژن های کاندیدای تحمل به شوری در مرحله گیاهچه ای برنج با استفاده از پی سی آر در زمان واقعی Keywords:

بیان ژن , پاسخ به تنش , حساس , ژن کاندیدا , متحمل

بررسی الگوی بیان نسبی ژن های کاندیدای تحمل به شوری در مرحله گیاهچه ای برنج با استفاده از پی سی آر در زمان واقعی authors

لیلا نیری پسند

گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران

قاسمعلی گروسی

گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران

اسدالله احمدی خواه

دانشگاه شهید بهشتی- دانشکده علوم و فناوری زیستی- گروه علوم و زیست فناوری گیاهی

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

توحیدی نژاد فاطمه، محمدآبادی محمدرضا، اسمعیلی زاده کشکوئیه علی، نجمی ...

بررسی بیان ژن CIB4 در بافت های مختلف گوسفند کرمانی با استفاده از Real Time qPCR [مقاله ژورنالی]

محمدآبادی محمدرضا، کرد محبوبه، نظری محمود (1397) مطالعه بیان ژن ...

Ahsani MR, Mohammadabadi MR, Asadi Fozi M et al. (2019a) ...

Ahsani MR, Mohammadabadi MR, Asadi Fozi M et al. (2019b) ...

Ayala F, Ashraf M, O Leary JW )1997( Plasma membrane ...

Benitez LC, da Maia LC, Ribeiro MV et al. )2013) ...

Bennetzen J )2002) Opening the door to comparative plant biology. ...

Cho K, Agrawal GK, Jwa NS et al. (2009) Rice ...

Dai Yin CH, Luo YH, Min SH et al. (2005) ...

Du H, Zhou X, Yang Q et al. (2015) Changes ...

Falhof J, Pedersen JT, Fuglsang AT, Palmgren M (2016) Plasma ...

Fan HF, Du CX, Guo SR (2013) Nitric oxide enhances ...

Finnie C, Borch J, Collinge DB (1999) 14-3-3 proteins: eukaryotic ...

Ganguly M, Datta K, Roychoudhury A et al. (2012) Overexpression ...

Gévaudant F, Duby G, Von Stedingk E et al. (2007) ...

Gong DS, Xiong YC, Ma BL et al. (2010) Early ...

Gossett DR, Millhollon EP, Lucas M (1994) Antioxidant response to ...

Grover A, Pental D (2003) Breeding objectives and requirements for ...

Hernandez JA, Olmos E, Corpas FJ et al. (1995) Salt-induced ...

Hu L, Li H, Chen L et al. (2015) RNA-seq ...

Islam F, Wang J, Farooq MA et al. (2019) Rice ...

Jafari Darehdor AH, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK, Riahi Madvar A ...

Kennedy B, De Filippis LF (1999) Physiological and oxidative response ...

Khare T, Kumar V, Kishor PK (2015) Na+ and Cl− ...

Kim CY, Liu Y, Thorne ET et al. (2003) Activation ...

Kim YH, Khan AL, Waqas M et al. (2014) Silicon ...

Kim D, Shibato J, Agrawal GK (2007) Gene transcription in ...

Lakra N, Nutan KK, Das P et al. (2015) A ...

Lee MO, Cho K, Kim SH et al. (2008) Novel ...

Lee DH, Kim YS, Lee CB (2001) The inductive responses ...

Livak KJ, Schmittgen TD (2001) Analysis of relative gene expression ...

Martz F, Sutinen ML, Kiviniemi S, Palta JP (2006) Changes ...

Mishra P, Bhoomika K, Dubey RS (2013) Differential responses of ...

Mittova V, Tal M, Volokita M, Guy M (2002) Salt ...

Mittova V, Tal M, Volokita M, Guy M (2003) Up‐regulation ...

Mishra S, Singh B, Panda K et al. (2016) Association ...

Mohammadabadi MR, Kord M, Nazari M (2019) Studying expression of ...

Morgan SH, Maity PJ, Geilfus CM et al. (2014) Leaf ...

Nayyeripasand L, Garoosi GA, Ahmadikhah A (2019) Selection for salinity ...

Niu X, Narasimhan ML, Salzman RA et al. (1993) NaCl ...

Niu X, Damsz B, Kononowicz AK et al. (1996) NaCl-induced ...

Paul AL, Liu L, McClung S et al. (2009) Comparative ...

Pfaffl MW (2001) A new mathematical model for relative quantification ...

Rahman A, Nahar K, Hasanuzzaman M, Fujita M (2016) Calcium ...

Rhodes D, Hanson AD (1993) Quaternary ammonium and tertiary sulfonium ...

Roy P, Niyogi K, Sengupta DN, Ghosh B (2005) Spermidine ...

Sasaki T, Sederoff RR (2003) Genome studies and molecular genetics: ...

Sehmer L, Alaoui-Sosse B, Dizengremel P (1995) Effect of salt ...

Shankar R, Bhattacharjee A, Jain M (2016) Transcriptome analysis in ...

Mishra S, Singh B, Panda K et al. (2016) Association ...

Svennelid F, Olsson A, Piotrowski M et al. (1999) Phosphorylation ...

Swain DM, Sahoo RK, Srivastava VK et al. (2017) Function ...

Tajti J, Németh E, Glatz G et al. (2019) Pattern ...

Tohidi Nezhad F, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK et al. (2015) ...

Vallee BL, Falchuk KH (1993) The biochemical basis of zinc ...

Vitart V, Baxter I, Doerner P, Harper JF (2001) Evidence ...

Visconti S, Camoni L, Fullone MR et al. (2003) Mutational ...

Yamane K, Mitsuya S, Taniguchi M, Miyake H (2010) Transcription ...

Yoshida S, Forno D, Cock JH, Gomez K (1976) Routine ...

Zeng L, Shannon MC, Lesch SM (2001) Timing of salinity ...

Zhao K, Tung CW, Eizenga GC et al. (2011) Genome-wide ...

Zhang S, Klessig DF (1997) Salicylic acid activates a 48-kD ...

نمایش کامل مراجع