تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae جدا شده از مزارع برنج استان گیلان
صاحب اثر: سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
نوع محتوی: طرح پژوهشی
Language: Persian
استان موضوع گزارش: گیلان
شهر موضوع گزارش: رشت
Document ID: R-1093626
Publish: 16 February 2019
دسته بندی علمی: علوم کشاورزی
View: 192
Pages: 32
Publish Year: 1390
نسخه کامل Research منتشر نشده است و در دسترس نیست.
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
Abstract:
باکتریPseudomonas syringae pv. syringae (Pss) در برنج بیماری زا بوده و باعث پوسیدگی غلاف و سوختگی بذر برنج می شود. بیماری ایجاد شده توسط این باکتری می تواند عملکرد محصول و کیفیت بذر را کاهش دهد. در این بررسی سی و هشت جدایه از این باکتری که از خزانه و مزارع برنج استان گیلان نمونه برداری و شناسایی شده بودند، با استفاده از نشانگرهای RAPD مورد ارزیابی قرار گرفتند. در این تحقیق سه جمعیت شامل جدایه های جمع آوری شده از اندام های برنج در مزرعه، در مرحله خوشه دهی و گیاهچه ای (خزانه) و همچنین یک جدایه مرجع(CFBP 2535) Xanthomonas arboricola pv. pruni به عنوان خارج از گروه (out group) مد نظر قرار داده شدند. جدایهصهای Pss از ارقام علی کاظمی، هاشمی و خزر جداسازی شدند. ده آغازگر به کار برده شده در مجموع 200 نوار چندشکل ایجاد کردند ( 99/5 %). بیشترین میزان اطلاعات چندشکل مربوط به آغازگر 70/9 (0/42) و کمترین مقدار آن مربوط به آغازگر 19/0) 12-OPA) بود. تجزیه واریانس مولکولی دادهصهای RAPD نشان داد که تفاوت ژنتیکی بین جمعیتی بیشتر از تفاوت درون جمعیت ها است. با تجزیه ژنتیکی جمعیت های مورد بررسی مشخص شد که بیشترین تشابه ژنتیکی بین جدایه های خوشه و خزانه و کمترین تشابه ژنتیکی بین جدایه های مزرعه و خزانه است. تجزیه خوشه ای به روش UPGMA و با استفاده از ضریب تشابه دایس انجام شد. در سطح تشابه 0/5 جدایه ها در 4 گروه مجزا قرار گرفتند. گروه اول شامل تمامی جدایه های مزرعه، گروه دوم شامل 7 جدایه از خوشه و گروه سوم در سطح تشابه 0/65 از دو زیر گروه، جدایه های خوشه و جدایه های خزانه تشکیل شده است. نتایج نشان داد که نشانگر RAPD قادر به تفکیک جدایه ها از یکدیگر در مراحل مزرعه، خوشه دهی و گیاهچه ای در خزانه می باشد. کلید واژه: برنج، تنوع ژنتیکی، Pseudomonas syringae pv. syringae و RAPD
Authors