تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی باکتری ‭Pseudomonas syringae pv. syringae ‬جدا شده از مزارع برنج استان گیلان

باکتری‭Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) ‬در برنج بیماری زا بوده و باعث پوسیدگی غلاف و سوختگی بذر برنج می شود. بیماری ایجاد شده توسط این باکتری می تواند عملکرد محصول و کیفیت بذر را کاهش دهد. در این بررسی سی و هشت جدایه از این باکتری که از خزانه و مزارع برنج استان گیلان نمونه برداری و شناسایی شده بودند، با استفاده از نشانگرهای ‭RAPD ‬مورد ارزیابی قرار گرفتند. در این تحقیق سه جمعیت شامل جدایه های جمع آوری شده از اندام های برنج در مزرعه، در مرحله خوشه دهی و گیاهچه ای (خزانه) و همچنین یک جدایه مرجع‭(CFBP ‬‮‭2535‬‭) Xanthomonas arboricola pv. pruni ‬به عنوان خارج از گروه ‭(out group) ‬مد نظر قرار داده شدند. جدایهصهای ‭Pss ‬از ارقام علی کاظمی، هاشمی و خزر جداسازی شدند. ده آغازگر به کار برده شده در مجموع ‮‭200‬ نوار چندشکل ایجاد کردند ( ‮‭99/5‬ %). بیشترین میزان اطلاعات چندشکل مربوط به آغازگر ‮‭70/9‬ (‮‭0/42‬) و کمترین مقدار آن مربوط به آغازگر ‮‭19/0‬) ‮‭12‬‭-OPA) ‬بود. تجزیه واریانس مولکولی دادهصهای ‭RAPD ‬نشان داد که تفاوت ژنتیکی بین جمعیتی بیشتر از تفاوت درون جمعیت ها است. با تجزیه ژنتیکی جمعیت های مورد بررسی مشخص شد که بیشترین تشابه ژنتیکی بین جدایه های خوشه و خزانه و کمترین تشابه ژنتیکی بین جدایه های مزرعه و خزانه است. تجزیه خوشه ای به روش ‭UPGMA ‬و با استفاده از ضریب تشابه دایس انجام شد. در سطح تشابه ‮‭0/5‬ جدایه ها در 4 گروه مجزا قرار گرفتند. گروه اول شامل تمامی جدایه های مزرعه، گروه دوم شامل 7 جدایه از خوشه و گروه سوم در سطح تشابه ‮‭0/65‬ از دو زیر گروه، جدایه های خوشه و جدایه های خزانه تشکیل شده است. نتایج نشان داد که نشانگر ‭RAPD ‬قادر به تفکیک جدایه ها از یکدیگر در مراحل مزرعه، خوشه دهی و گیاهچه ای در خزانه می باشد. کلید واژه: برنج، تنوع ژنتیکی، ‭Pseudomonas syringae pv. syringae ‬و ‭RAPD