طراحی و ساخت سازه شبیه ساز جهت تشخیص باکتری بورخولدریا مالئی و سودومالئی

محمدجواد دهقان عصمت آبادی; محمود براتی; محمدعلی یعقوبی مقدم

طراحی و ساخت سازه شبیه ساز جهت تشخیص باکتری بورخولدریا مالئی و سودومالئی

Publish place: New Cellular Biotechnology - Molecular، Vol: 10، Issue: 40

Publish Year: 1399

نوع سند: مقاله ژورنالی

زبان: Persian

This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download

دریافت فایل کامل Paper

Certificate
من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

https://civilica.com/doc/1162290

شناسه ملی سند علمی:

JR_NCMBJ-10-40_005

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399

Abstract:

سابقه و هدف: باکتری های بورخولدریا مالئی و سودومالئی (Burkholderia mallei and pseudomallei species) جزو عوامل بیماری زای خطرناک انسانی محسوب می شوند. تشخیص برپایه کشت برای این باکتری، هزینه بر و زمان بر و از طرف دیگر کار با این باکتری بسیار خطرناک بوده و همچنین امکان دسترسی به این باکتری و حتی ژنوم آن بسیار مشکل می باشد. هدف از انجام این مطالعه طراحی و سنتز کنترل مثبتی ایمن و کارآمد برای تشخیص باکتری بورخولدریا می باشد. مواد و روش ها: در ابتدا، یک سازه شبیه ساز که، حاوی ژن های مرجع و اختصاصی باکتری بورخولدریا مالئی و سودومالئی می باشد و در دیگر گونه های خانواده مشاهده نمیشود ساخته شد و سپس کارایی عملیاتی سازه طراحی شده، با استفاده از روشPCR Real-Time کمی ( با استفاده از رنگ SYBER Green ) و کیفی(با استفاده از پروب TaqMan )، مورد ارزیابی قرار گرفت. درنهایت محصولات تکثیری PCR Real-Time با استفاده از منحنی ذوب و الکتروفورز مورد بررسی قرار گرفتند. یافته ها: میزان حداقل و حداکثر حساسیت به ترتیب 1/0پیکو گرم و 10 نانوگرم بر روی سازه طراحی شده در مطالعه حاضر، حاصل شد. نتیجه گیری: این سازه شبیه ساز میتواند به عنوان کنترل مثبت مناسبی، جهت تشخیص عامل بورخولدریا مورد استفاده قرار گیرد و همچنین می تواند در آینده باعث پیشرفت هرچه بیشتر کیت های تشخیصی جدید در این حوزه بشود.

Keywords:

pathogens , Burkholderia , Real Time PCR , cloning , SYBR Green , پاتوژن ها , بورخولدریا , Real Time PCR , کلونینگ , SYBER Green

Authors

محمدجواد دهقان عصمت آبادی

Maleke Ashtar University, Tehran, Iran

محمود براتی

Department of Medical Biotechnology, School of Allied Medical Sciences Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran

محمدعلی یعقوبی مقدم

Maleke Ashtar University, Tehran, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

1. Brown TA. Gene cloning and DNA analysis: an introduction: ...
2. Kostylev M, Otwell AE, Richardson RE, Suzuki Y. Cloning ...
3. Charrel RN, La Scola B, Raoult D. Multi-pathogens sequence ...
4. Carrera M, Sagripanti JL. Non-infectious plasmid engineered to simulate ...
5. Carrera M, Sagripanti JL. Artificial plasmid engineered to simulate ...
6. Saxena A, Pal V, Tripathi NK, Goel AK. Development ...
7. Saxena A, Pal V, Tripathi NK, Goel AK. A ...
8. Shi L, Chen J, Yi G. Burkholderia pseudomallei was ...
9. Peng Y, Zheng X, Kan B, Li W, Zhang ...
10. Estrada-de los Santos P, Vinuesa P, Martinez-Aguilar L, Hirsch ...
11. Torres AG, Hall CM, Jaramillo S, Jimenez R, Stone ...
12. Khakhum N, Chapartegui-Gonzalez I, Torres AG. Combating the great ...
13. Saiprom N, Sangsri T, Tandhavanant S, Sengyee S, Phunpang ...
14. Whitlock GC, Estes DM, Torres AG. Glanders: off to ...
15. Losada L, Ronning CM, DeShazer D, Woods D, Fedorova ...
16. Bondi SK, Goldberg JB. Strategies toward vaccines againstBurkholderia malleiandBurkholderia ...
17. Moawad AA, Silge A, Bocklitz T, Fischer K, Rosch ...
18. Khakhum N, Tapia D, Torres AG. Burkholderia mallei and ...
19. Cheng AC, Currie BJ. Melioidosis: epidemiology, pathophysiology, and management. ...
20. Bauernfeind A, Roller C, Meyer D, Jungwirth R, Schneider ...
21. Larson DT, Schully KL, Spall A, Lawler JV, Maves ...
22. Chua KH, Tan EW, Chai HC, Puthucheary SD, Lee ...
23. Ulrich MP, Norwood DA, Christensen DR, Ulrich RL. Using ...
24. Logan J, Logan JM, Edwards KJ, Saunders NA. Real-time ...
25. Bustin SA, Benes V, Garson JA, Hellemans J, Huggett ...
26. Hodgson K, Engler C, Govan B, Ketheesan N, Norton ...
27. Kaestli M, Mayo M, Harrington G, Watt F, Hill ...
28. Lee M-A, Wang D, Yap EH. Detection and differentiation ...
29. Merritt A, Inglis TJJ, Chidlow G, Harnett G. PCR-based ...
30. Novak RT, Glass MB, Gee JE, Gal D, Mayo ...
31. Supaprom C, Wang D, Leelayuwat C, Thaewpia W, Susaengrat ...
32. Thibault FM, Valade E, Vidal DR. Identification and discrimination ...
33. Bowers JR, Engelthaler DM, Ginther JL, Pearson T, Peacock ...
34. Podnecky NL, Elrod MG, Newton BR, Dauphin LA, Shi ...
35. Suppiah J, Thimma JS, Cheah SH, Vadivelu J. Development ...
36. Price EP, Dale JL, Cook JM, Sarovich DS, Seymour ...
1. Brown TA. Gene cloning and DNA analysis: an introduction: ...
2. Kostylev M, Otwell AE, Richardson RE, Suzuki Y. Cloning ...
3. Charrel RN, La Scola B, Raoult D. Multi-pathogens sequence ...
4. Carrera M, Sagripanti JL. Non-infectious plasmid engineered to simulate ...
5. Carrera M, Sagripanti JL. Artificial plasmid engineered to simulate ...
6. Saxena A, Pal V, Tripathi NK, Goel AK. Development ...
7. Saxena A, Pal V, Tripathi NK, Goel AK. A ...
8. Shi L, Chen J, Yi G. Burkholderia pseudomallei was ...
9. Peng Y, Zheng X, Kan B, Li W, Zhang ...
10. Estrada-de los Santos P, Vinuesa P, Martinez-Aguilar L, Hirsch ...
11. Torres AG, Hall CM, Jaramillo S, Jimenez R, Stone ...
12. Khakhum N, Chapartegui-Gonzalez I, Torres AG. Combating the great ...
13. Saiprom N, Sangsri T, Tandhavanant S, Sengyee S, Phunpang ...
14. Whitlock GC, Estes DM, Torres AG. Glanders: off to ...
15. Losada L, Ronning CM, DeShazer D, Woods D, Fedorova ...
16. Bondi SK, Goldberg JB. Strategies toward vaccines againstBurkholderia malleiandBurkholderia ...
17. Moawad AA, Silge A, Bocklitz T, Fischer K, Rosch ...
18. Khakhum N, Tapia D, Torres AG. Burkholderia mallei and ...
19. Cheng AC, Currie BJ. Melioidosis: epidemiology, pathophysiology, and management. ...
20. Bauernfeind A, Roller C, Meyer D, Jungwirth R, Schneider ...
21. Larson DT, Schully KL, Spall A, Lawler JV, Maves ...
22. Chua KH, Tan EW, Chai HC, Puthucheary SD, Lee ...
23. Ulrich MP, Norwood DA, Christensen DR, Ulrich RL. Using ...
24. Logan J, Logan JM, Edwards KJ, Saunders NA. Real-time ...
25. Bustin SA, Benes V, Garson JA, Hellemans J, Huggett ...
26. Hodgson K, Engler C, Govan B, Ketheesan N, Norton ...
27. Kaestli M, Mayo M, Harrington G, Watt F, Hill ...
28. Lee M-A, Wang D, Yap EH. Detection and differentiation ...
29. Merritt A, Inglis TJJ, Chidlow G, Harnett G. PCR-based ...
30. Novak RT, Glass MB, Gee JE, Gal D, Mayo ...
31. Supaprom C, Wang D, Leelayuwat C, Thaewpia W, Susaengrat ...
32. Thibault FM, Valade E, Vidal DR. Identification and discrimination ...
33. Bowers JR, Engelthaler DM, Ginther JL, Pearson T, Peacock ...
34. Podnecky NL, Elrod MG, Newton BR, Dauphin LA, Shi ...
35. Suppiah J, Thimma JS, Cheah SH, Vadivelu J. Development ...
36. Price EP, Dale JL, Cook JM, Sarovich DS, Seymour ...

نمایش کامل مراجع